110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_06071 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  100 
 
 
185 aa  387  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  67.96 
 
 
155 aa  152  2e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0781  nuclease (SNase-like)  68.27 
 
 
114 aa  138  6e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0368621  normal  0.0365666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  39.42 
 
 
155 aa  67.4  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  39.39 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.79 
 
 
227 aa  64.7  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 
183 aa  62.8  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  37.11 
 
 
333 aa  61.6  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.34 
 
 
148 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  40.62 
 
 
162 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  42.65 
 
 
138 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  32.2 
 
 
186 aa  58.2  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 
153 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  37.61 
 
 
238 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.04 
 
 
153 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  34.45 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  31.07 
 
 
153 aa  55.5  0.0000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  34 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.25 
 
 
187 aa  53.9  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.43 
 
 
233 aa  53.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.32 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.09 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  37.62 
 
 
227 aa  50.8  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  29.52 
 
 
148 aa  50.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.09 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.09 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.29 
 
 
182 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  40.24 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  40.24 
 
 
171 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  30.3 
 
 
196 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.33 
 
 
216 aa  49.7  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0050  hypothetical protein  32.93 
 
 
109 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00096516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.45 
 
 
187 aa  49.3  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  29.73 
 
 
169 aa  49.7  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.08 
 
 
161 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.11 
 
 
166 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  27.13 
 
 
284 aa  48.9  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  32.43 
 
 
157 aa  48.5  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  30.93 
 
 
122 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 
272 aa  48.5  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.9 
 
 
150 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.67 
 
 
232 aa  48.1  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.2 
 
 
171 aa  48.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.65 
 
 
171 aa  48.1  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
260 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  32.61 
 
 
157 aa  47  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  37 
 
 
172 aa  47.8  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  30.84 
 
 
169 aa  47.4  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  34.69 
 
 
256 aa  47.4  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  32.99 
 
 
170 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.18 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  31.3 
 
 
272 aa  47.4  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 
228 aa  47  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  35.44 
 
 
164 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  30.36 
 
 
212 aa  46.6  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  31.63 
 
 
276 aa  46.2  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.91 
 
 
255 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  32 
 
 
185 aa  46.2  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  33.68 
 
 
242 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 
301 aa  46.2  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  36.17 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  31.63 
 
 
214 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.91 
 
 
273 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  33 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  32.61 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  31.19 
 
 
175 aa  46.2  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  32.04 
 
 
242 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  31.63 
 
 
214 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  33.66 
 
 
278 aa  45.8  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  27.55 
 
 
156 aa  45.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  31.63 
 
 
226 aa  45.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  31.46 
 
 
164 aa  45.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.09 
 
 
183 aa  45.1  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.33 
 
 
286 aa  45.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  31.73 
 
 
114 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  31.37 
 
 
240 aa  45.1  0.0006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  34.23 
 
 
259 aa  44.7  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.43 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  29.7 
 
 
153 aa  44.7  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  31.96 
 
 
257 aa  44.7  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.43 
 
 
214 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 
158 aa  44.7  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  38.24 
 
 
206 aa  43.9  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  30.11 
 
 
166 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.56 
 
 
136 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1110  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  38.1 
 
 
280 aa  43.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  27.83 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  37.84 
 
 
260 aa  43.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  29.47 
 
 
273 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  34.65 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.84 
 
 
158 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  30.53 
 
 
267 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  30.85 
 
 
255 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.93 
 
 
227 aa  42.7  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 
179 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  31.68 
 
 
178 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  32.2 
 
 
146 aa  42  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>