211 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1380 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 238 aa  500  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  42.62 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  41.18 
 
 		 232 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  41.44 
 
 		 184 aa  148  8e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  45.45 
 
 		 161 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  39.31 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  44.67 
 
 		 153 aa  125  8.000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  43.33 
 
 		 153 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  41.03 
 
 		 221 aa  123  3e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  41.29 
 
 		 148 aa  122  5e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.75 
 
 		 192 aa  121  9e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  37.34 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  38.07 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  47.01 
 
 		 150 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  35.48 
 
 		 174 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  38.96 
 
 		 206 aa  120  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  39.16 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  35.42 
 
 		 153 aa  118  7.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  36.59 
 
 		 216 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.69 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  39.46 
 
 		 153 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2368  nuclease (SNase domain protein)  42.64 
 
 		 122 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  42.25 
 
 		 193 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  40.13 
 
 		 175 aa  112  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  41.86 
 
 		 153 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  38.41 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  41.45 
 
 		 175 aa  111  1.0000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.5 
 
 		 171 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  40.79 
 
 		 175 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  39.86 
 
 		 171 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  34.88 
 
 		 180 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  34.87 
 
 		 162 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.1 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  33.33 
 
 		 194 aa  105  9e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  37.5 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  35.76 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  36.84 
 
 		 157 aa  102  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  38.93 
 
 		 191 aa  102  7e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.37 
 
 		 164 aa  101  8e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  38.93 
 
 		 205 aa  101  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  35.37 
 
 		 158 aa  101  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  39.84 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  35.37 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  35.33 
 
 		 185 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.33 
 
 		 187 aa  99.8  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  38.67 
 
 		 171 aa  98.2  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  32.48 
 
 		 167 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  39.13 
 
 		 187 aa  96.7  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  35.57 
 
 		 166 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  36.76 
 
 		 182 aa  96.3  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  28.51 
 
 		 271 aa  95.5  7e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  35.11 
 
 		 138 aa  95.1  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  40.85 
 
 		 162 aa  92.8  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.57 
 
 		 227 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.93 
 
 		 169 aa  91.3  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  34.67 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  41.98 
 
 		 208 aa  90.1  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  37.58 
 
 		 155 aa  86.3  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  33.95 
 
 		 175 aa  84.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.76 
 
 		 199 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  33.56 
 
 		 157 aa  83.2  0.000000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  37.21 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.08 
 
 		 183 aa  78.2  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.82 
 
 		 233 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  32.67 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  36.72 
 
 		 388 aa  76.3  0.0000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  35.61 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  34.46 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0502  hypothetical protein  48.44 
 
 		 77 aa  73.6  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  30.73 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  26.46 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.91 
 
 		 171 aa  71.6  0.000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  32.09 
 
 		 168 aa  70.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.61 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.73 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  29.33 
 
 		 175 aa  68.6  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  34.15 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  37.5 
 
 		 158 aa  68.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  32.96 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 171 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 171 aa  67  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  29.07 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  32.35 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  32.35 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 191 aa  65.5  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  26.64 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.82 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.01 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.8 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  30.06 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  28.26 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  31.58 
 
 		 155 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.11 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  37.69 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  28.22 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  28.28 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>