138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_2776 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
186 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  67.57 
 
 
187 aa  267  8e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0881  nuclease (SNase-like)  39.64 
 
 
267 aa  113  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.456641  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.59 
 
 
227 aa  99.8  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  38.56 
 
 
179 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  35.56 
 
 
183 aa  89.4  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35.47 
 
 
155 aa  89  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  34.21 
 
 
233 aa  85.1  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.49 
 
 
158 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  36.84 
 
 
162 aa  77.4  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  34.42 
 
 
187 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  35.29 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.89 
 
 
169 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.85 
 
 
278 aa  71.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  33.33 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  31.55 
 
 
157 aa  70.1  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  32.48 
 
 
185 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  30.95 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.6 
 
 
171 aa  68.6  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  28.89 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.41 
 
 
187 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.65 
 
 
153 aa  67.8  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.98 
 
 
153 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  34.69 
 
 
193 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.18 
 
 
153 aa  67.4  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  34.19 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  30.41 
 
 
171 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.87 
 
 
185 aa  65.9  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.48 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.76 
 
 
244 aa  64.7  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  31.79 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 
221 aa  63.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.78 
 
 
206 aa  61.6  0.000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.33 
 
 
156 aa  61.6  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  28.26 
 
 
232 aa  61.2  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.58 
 
 
209 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.88 
 
 
224 aa  60.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  25.86 
 
 
169 aa  60.5  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.25 
 
 
161 aa  60.8  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.77 
 
 
192 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  32.26 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  28.86 
 
 
238 aa  59.7  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  32.26 
 
 
171 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.81 
 
 
180 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  28.86 
 
 
286 aa  58.2  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  27.62 
 
 
247 aa  58.2  0.00000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  31.91 
 
 
273 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  32.2 
 
 
185 aa  58.2  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.21 
 
 
255 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.87 
 
 
227 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  30.87 
 
 
205 aa  57  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  33.05 
 
 
155 aa  57.4  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.87 
 
 
255 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  30.87 
 
 
191 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  25.54 
 
 
184 aa  57.4  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  30.99 
 
 
247 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  28.98 
 
 
174 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  31.43 
 
 
240 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  26.04 
 
 
192 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 
260 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.81 
 
 
183 aa  55.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  28.08 
 
 
216 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.25 
 
 
266 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  25.99 
 
 
175 aa  54.7  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  28.48 
 
 
162 aa  54.7  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  30.5 
 
 
276 aa  54.7  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  26.32 
 
 
178 aa  54.7  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.7 
 
 
175 aa  54.3  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.74 
 
 
148 aa  54.3  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  29.58 
 
 
267 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  25.42 
 
 
175 aa  54.3  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  24.16 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  34.64 
 
 
208 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  24.82 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  27.34 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  24.82 
 
 
228 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  27.34 
 
 
190 aa  53.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  30.77 
 
 
273 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  23.63 
 
 
166 aa  52.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  27.46 
 
 
255 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  28.89 
 
 
231 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  27.52 
 
 
175 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 
200 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.92 
 
 
214 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  26.97 
 
 
284 aa  51.6  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
180 aa  51.6  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 
154 aa  51.2  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  28.08 
 
 
189 aa  51.2  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  30.43 
 
 
150 aa  50.8  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  32.45 
 
 
175 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  32.89 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  25.68 
 
 
228 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  29.61 
 
 
167 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  28.67 
 
 
273 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  30.38 
 
 
175 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  31.86 
 
 
333 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  28.67 
 
 
272 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  30.54 
 
 
273 aa  48.9  0.00004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.81 
 
 
171 aa  48.9  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.8 
 
 
225 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>