29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf871 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf871  nuclease, lipoprotein  100 
 
 
234 aa  474  1e-133  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  30.67 
 
 
183 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  29.45 
 
 
183 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  27.61 
 
 
273 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30 
 
 
178 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.85 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.85 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  27.95 
 
 
255 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  26.54 
 
 
190 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  26.28 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  27.33 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  26.54 
 
 
190 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  25.95 
 
 
260 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  26.25 
 
 
271 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  24.38 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  27.56 
 
 
276 aa  50.8  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  28.95 
 
 
266 aa  50.8  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  25.81 
 
 
267 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  25.31 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  25.15 
 
 
255 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  27.74 
 
 
166 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  25.81 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  24.52 
 
 
266 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.97 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  30.09 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  27.01 
 
 
180 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  25.79 
 
 
183 aa  42.4  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  22.7 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  24.16 
 
 
218 aa  42  0.009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>