137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1118 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 180 aa  372  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  42.77 
 
 		 271 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  44.16 
 
 		 237 aa  103  1e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  40.99 
 
 		 327 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  44.44 
 
 		 276 aa  102  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  34.74 
 
 		 178 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  41.83 
 
 		 346 aa  98.6  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  38.56 
 
 		 351 aa  97.8  7e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  41.1 
 
 		 350 aa  95.5  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  39.44 
 
 		 175 aa  94  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  42.25 
 
 		 258 aa  92.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  36.23 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  36.23 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  37.24 
 
 		 218 aa  89  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  33.99 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  33.99 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  40 
 
 		 374 aa  85.5  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  37.32 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  34.78 
 
 		 408 aa  83.2  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  31.75 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  31.9 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  34.75 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  34.83 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  30.39 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  30.27 
 
 		 249 aa  78.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  36.05 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  35.44 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  37.32 
 
 		 273 aa  76.3  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  37.06 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  31.08 
 
 		 278 aa  75.5  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  29.83 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  35.62 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  35.37 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  33.11 
 
 		 266 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  33.1 
 
 		 273 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 255 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  34.25 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  29.83 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  29.89 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  32.19 
 
 		 260 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  36.73 
 
 		 272 aa  70.9  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  34.27 
 
 		 273 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 382 aa  70.1  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  34.9 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  28.02 
 
 		 372 aa  69.3  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  32.86 
 
 		 257 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  36.42 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.11 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  33.79 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  32.19 
 
 		 286 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  34.51 
 
 		 273 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.33 
 
 		 166 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  32.39 
 
 		 166 aa  65.9  0.0000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  32.39 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  32.28 
 
 		 311 aa  64.7  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  32 
 
 		 256 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  33.56 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  33.56 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  31.43 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  29.08 
 
 		 161 aa  60.5  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  28.38 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  32.43 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.62 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  35.62 
 
 		 324 aa  58.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  31.47 
 
 		 238 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  29.93 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  33.33 
 
 		 161 aa  57.8  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 		 301 aa  57.8  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.77 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.77 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  29.79 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.47 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  30.57 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.37 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  28.86 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  35.81 
 
 		 323 aa  54.3  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  34.23 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  34.23 
 
 		 162 aa  53.9  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  28.76 
 
 		 308 aa  53.5  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  27.84 
 
 		 171 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.4 
 
 		 263 aa  52.4  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.29 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  26.37 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30 
 
 		 153 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.13 
 
 		 221 aa  51.6  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.74 
 
 		 179 aa  50.8  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  28.49 
 
 		 178 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  35.19 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  33.04 
 
 		 115 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  28.67 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  29.94 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  30.88 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  34.4 
 
 		 146 aa  48.5  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>