186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1900 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 266 aa  542  1e-153  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  36.7 
 
 		 276 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  39.41 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  43.07 
 
 		 327 aa  94.7  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  42.97 
 
 		 178 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  37.58 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  39.84 
 
 		 190 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  39.84 
 
 		 190 aa  90.5  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  38.46 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  26.99 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.03 
 
 		 190 aa  81.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  37.76 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  40.62 
 
 		 258 aa  81.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  34.93 
 
 		 273 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  37.59 
 
 		 350 aa  80.1  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  30.04 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  36.05 
 
 		 163 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  32.74 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  38.24 
 
 		 346 aa  77.8  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  35.44 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  29.63 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  35.44 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  27.48 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  28.12 
 
 		 272 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 		 166 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.22 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  34.29 
 
 		 351 aa  74.3  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  37.19 
 
 		 388 aa  73.6  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.65 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  27.16 
 
 		 255 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  24 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  31.32 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  34.69 
 
 		 273 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  35.16 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  32.72 
 
 		 231 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  29.71 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  35.98 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  36 
 
 		 372 aa  70.1  0.00000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  31.32 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.57 
 
 		 148 aa  69.7  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  37.5 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  28.25 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.08 
 
 		 232 aa  69.3  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  37.01 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  36.49 
 
 		 175 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  26.34 
 
 		 255 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.76 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.74 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.72 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  30.51 
 
 		 183 aa  67  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  32.03 
 
 		 240 aa  66.6  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  24.41 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  31.33 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.58 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  35.48 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.8 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.65 
 
 		 168 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  46.24 
 
 		 115 aa  63.5  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.79 
 
 		 209 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.17 
 
 		 169 aa  63.2  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  25.99 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.41 
 
 		 153 aa  62  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  35.25 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.26 
 
 		 175 aa  62  0.00000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30 
 
 		 180 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.4 
 
 		 166 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.52 
 
 		 161 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  36.23 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.33 
 
 		 187 aa  61.6  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  30.58 
 
 		 244 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.26 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  34.09 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  34.09 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  33.06 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  36.94 
 
 		 382 aa  60.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.01 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.7 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  32.28 
 
 		 408 aa  59.7  0.00000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  29.59 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.06 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4243  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  32.32 
 
 		 713 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.562267  normal  0.0150792 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  29.75 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  33.87 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  28.8 
 
 		 169 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.79 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 184 aa  57  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.75 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3304  hypothetical protein  24.73 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.293773 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.48 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  28.87 
 
 		 273 aa  55.5  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.81 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.25 
 
 		 136 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  28 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  28 
 
 		 205 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  30.38 
 
 		 225 aa  55.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  29.93 
 
 		 162 aa  54.3  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>