102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_1176 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  100 
 
 		 282 aa  558  1e-158  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0612  hypothetical protein  36.97 
 
 		 176 aa  91.3  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  34.25 
 
 		 190 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  34.25 
 
 		 190 aa  89  9e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  34.87 
 
 		 178 aa  87.8  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  34.12 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  28.03 
 
 		 256 aa  79  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 		 180 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  29.96 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  31.06 
 
 		 408 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  31.72 
 
 		 237 aa  69.3  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  32.48 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  28.98 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  28.05 
 
 		 327 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  31.61 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  30.53 
 
 		 247 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  35.56 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  26.79 
 
 		 266 aa  62.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  30.57 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  27.61 
 
 		 273 aa  62  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  38.26 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  29.94 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.07 
 
 		 272 aa  61.6  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  26.88 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.2 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.2 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  30.46 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.1 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  30.71 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  31.16 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  29.45 
 
 		 228 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  36.52 
 
 		 324 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  31.2 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  32.11 
 
 		 374 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.64 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  36 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  30.67 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.65 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.05 
 
 		 166 aa  55.5  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  35.4 
 
 		 115 aa  54.7  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  32.26 
 
 		 192 aa  55.1  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  28.36 
 
 		 255 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  30.63 
 
 		 197 aa  55.1  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  30.46 
 
 		 209 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  32.32 
 
 		 183 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  36.61 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  30.37 
 
 		 284 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  36.61 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  32.61 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  26.55 
 
 		 267 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  37.78 
 
 		 174 aa  53.1  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  30.77 
 
 		 255 aa  52.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.53 
 
 		 148 aa  51.6  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  30.43 
 
 		 273 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  30.91 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.81 
 
 		 206 aa  51.2  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  32.21 
 
 		 273 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.41 
 
 		 179 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  32.61 
 
 		 372 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  30.36 
 
 		 382 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  32.81 
 
 		 214 aa  50.4  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  32.21 
 
 		 273 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  30.83 
 
 		 203 aa  50.1  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  28.06 
 
 		 263 aa  49.7  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0613  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  49.7  0.00005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  25.25 
 
 		 247 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  30.61 
 
 		 155 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  36.27 
 
 		 161 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  31.62 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  25.54 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  36.54 
 
 		 201 aa  47  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  25.26 
 
 		 187 aa  47.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  27.1 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.62 
 
 		 184 aa  47  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 192 aa  47  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  28.87 
 
 		 136 aa  46.6  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  27.59 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.73 
 
 		 388 aa  46.6  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  35.09 
 
 		 166 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  30.69 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  26.32 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  34.56 
 
 		 293 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  23.39 
 
 		 260 aa  44.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  30.28 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  25.97 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.6 
 
 		 232 aa  44.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  31.78 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  30.7 
 
 		 443 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  25 
 
 		 184 aa  43.9  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  23.03 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.34 
 
 		 199 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  27.33 
 
 		 163 aa  43.5  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0124  nuclease (SNase-like)  26.7 
 
 		 275 aa  43.1  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00271835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.63 
 
 		 228 aa  43.1  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  33.01 
 
 		 244 aa  43.1  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  27.34 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>