154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0374 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  100 
 
 		 346 aa  696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  76.59 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  65.4 
 
 		 350 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  43.87 
 
 		 258 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1312  hypothetical protein  49.04 
 
 		 345 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.175874  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  38.52 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  38.52 
 
 		 190 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  39.02 
 
 		 237 aa  105  8e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  41.83 
 
 		 180 aa  105  1e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  37.31 
 
 		 178 aa  105  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  41.18 
 
 		 388 aa  103  3e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  38.26 
 
 		 372 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  41.48 
 
 		 276 aa  99.4  9e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  42.77 
 
 		 200 aa  97.8  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  39.44 
 
 		 271 aa  97.1  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  44.03 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  43.18 
 
 		 259 aa  92  1e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  40.58 
 
 		 190 aa  90.5  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  41.61 
 
 		 175 aa  90.1  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  41.79 
 
 		 323 aa  89.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.81 
 
 		 228 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.81 
 
 		 228 aa  89  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  39.29 
 
 		 327 aa  87.8  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  38.24 
 
 		 266 aa  86.7  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  39.02 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  35.25 
 
 		 209 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  37.78 
 
 		 408 aa  84  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  36.97 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  34.06 
 
 		 214 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.56 
 
 		 192 aa  82  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  32.65 
 
 		 351 aa  80.1  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  32.82 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  32.82 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.93 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  31.03 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  37.41 
 
 		 222 aa  76.3  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  30.34 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.14 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  29.66 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  29.88 
 
 		 231 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  27.42 
 
 		 383 aa  70.5  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  49.44 
 
 		 443 aa  70.1  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  36.28 
 
 		 214 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.56 
 
 		 169 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.17 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  35.77 
 
 		 263 aa  68.2  0.0000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  36.11 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  29.07 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  37.93 
 
 		 191 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.56 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.52 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 272 aa  65.9  0.0000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 		 278 aa  65.9  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  30.46 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.59 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  26.58 
 
 		 148 aa  64.7  0.000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  33.33 
 
 		 231 aa  64.3  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  36.09 
 
 		 224 aa  64.7  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 161 aa  63.5  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  32.12 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2995  nuclease (SNase domain protein)  30.41 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.62 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.03 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  37.12 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  30.3 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.03 
 
 		 153 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  28.37 
 
 		 163 aa  61.6  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  23.66 
 
 		 192 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  29.66 
 
 		 171 aa  61.2  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  29.63 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  30.3 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  30.48 
 
 		 260 aa  60.5  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  28.03 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 333 aa  60.1  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  26.15 
 
 		 206 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.38 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  28.29 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  27.94 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  26.32 
 
 		 174 aa  59.3  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0407  nuclease (SNase-like)  29.68 
 
 		 308 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.17 
 
 		 179 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.99 
 
 		 266 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28.12 
 
 		 184 aa  58.5  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 183 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32.03 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.36 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  27.34 
 
 		 273 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.92 
 
 		 175 aa  57.4  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  29.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  29.66 
 
 		 197 aa  57  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.15 
 
 		 175 aa  57  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.94 
 
 		 161 aa  57  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  32.09 
 
 		 286 aa  57  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  27.59 
 
 		 157 aa  56.6  0.0000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.53 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.1 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>