186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1039 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 161 aa  329  9e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  50 
 
 		 184 aa  178  2e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  50.39 
 
 		 238 aa  141  4e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  37.42 
 
 		 232 aa  115  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  37.95 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  43.85 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  43.08 
 
 		 221 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  34.39 
 
 		 244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  38.06 
 
 		 153 aa  104  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  37.58 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  33.97 
 
 		 206 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  35.16 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  39.68 
 
 		 153 aa  103  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.54 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  38.89 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.64 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  37.8 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.69 
 
 		 156 aa  96.7  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.98 
 
 		 175 aa  95.9  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  40.16 
 
 		 196 aa  93.2  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  37.04 
 
 		 150 aa  92.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  32.26 
 
 		 216 aa  91.7  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 		 169 aa  91.7  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.9 
 
 		 164 aa  91.3  5e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.76 
 
 		 171 aa  88.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.18 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.06 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.41 
 
 		 175 aa  87.8  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.77 
 
 		 175 aa  87.8  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.13 
 
 		 175 aa  87.4  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  36.17 
 
 		 193 aa  87.4  8e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  37.69 
 
 		 225 aa  87.4  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.82 
 
 		 180 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 		 179 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  28.21 
 
 		 185 aa  86.3  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  35.81 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.15 
 
 		 138 aa  85.5  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35.77 
 
 		 171 aa  84.7  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  36.92 
 
 		 163 aa  84.3  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  32.26 
 
 		 228 aa  84.3  6e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.41 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  32.5 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  40 
 
 		 208 aa  80.9  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.12 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.62 
 
 		 158 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  33.58 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  38.35 
 
 		 194 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  35.29 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  31.58 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.95 
 
 		 155 aa  74.7  0.0000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.82 
 
 		 185 aa  74.7  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.39 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  34 
 
 		 157 aa  73.6  0.000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  32.2 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  32.85 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.11 
 
 		 199 aa  72  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.66 
 
 		 162 aa  72  0.000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  40.16 
 
 		 136 aa  70.1  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  26.22 
 
 		 227 aa  68.9  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.56 
 
 		 185 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.19 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.92 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  35.61 
 
 		 258 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  26.82 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  27.12 
 
 		 193 aa  63.9  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  26.87 
 
 		 233 aa  63.9  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.06 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2368  nuclease (SNase domain protein)  53.06 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.52 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  29.93 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  29.08 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43237  predicted protein  33.04 
 
 		 918 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.31647 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43350  predicted protein  33.04 
 
 		 918 aa  59.7  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  31.06 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  28.57 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  31.06 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  28.57 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  34.38 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.66 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  31.34 
 
 		 247 aa  57.8  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  32.81 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  36.03 
 
 		 534 aa  57.4  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2850  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 		 311 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  40.91 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 200 aa  57  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  29.14 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 171 aa  57  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  27.94 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.33 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.32 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  26.97 
 
 		 165 aa  55.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.61 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  33.33 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  30.43 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>