144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3427 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  100 
 
 		 263 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.88 
 
 		 272 aa  97.1  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  29.65 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  32.19 
 
 		 276 aa  84.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  32.11 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  31.84 
 
 		 266 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  31.03 
 
 		 267 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  35.76 
 
 		 255 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  29.58 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  35.93 
 
 		 272 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.86 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1371  nuclease  36.51 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.490456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  33.33 
 
 		 255 aa  76.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2298  nuclease  34.08 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.195217  normal  0.652893 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  30.64 
 
 		 266 aa  75.5  0.0000000000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  30.52 
 
 		 273 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  29.89 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0276  nuclease (SNase-like)  30.67 
 
 		 264 aa  72  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.1811 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  28.69 
 
 		 257 aa  72  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  28.78 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0553  nuclease (SNase-like)  32.11 
 
 		 269 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117842  normal  0.132209 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0551  nuclease (SNase-like)  29.8 
 
 		 258 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  35.71 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  27.64 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  34.68 
 
 		 224 aa  67.8  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  30.67 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  29.39 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0509  nuclease (SNase-like)  26.52 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.58824  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  36.73 
 
 		 171 aa  62  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0083  nuclease, SNase-like  31.68 
 
 		 274 aa  61.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2232  SNase-like nuclease  28.77 
 
 		 289 aa  60.8  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00607458 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  34.84 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.37 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.37 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.9 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  31.21 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  34.68 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  31.25 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  31.21 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  37.07 
 
 		 124 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 372 aa  58.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  33.58 
 
 		 158 aa  57.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  31.34 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  31.21 
 
 		 183 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.57 
 
 		 171 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  36.64 
 
 		 214 aa  57  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0487  nuclease (SNase domain protein)  28.81 
 
 		 262 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  37.98 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2433  micrococcal nuclease (thermonuclease)  38.81 
 
 		 170 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.64 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  34.45 
 
 		 346 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.23 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.14 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  39.05 
 
 		 350 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.14 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  34.29 
 
 		 374 aa  55.8  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.48 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.91 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.01 
 
 		 175 aa  55.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  31.21 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  32.68 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.23 
 
 		 175 aa  54.7  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38.19 
 
 		 214 aa  54.7  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  40.43 
 
 		 260 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0453  nuclease  25.09 
 
 		 259 aa  53.9  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.686842 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  38.41 
 
 		 191 aa  53.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.15 
 
 		 284 aa  53.1  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25.56 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  37.11 
 
 		 163 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  31.75 
 
 		 153 aa  52.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.71 
 
 		 179 aa  52.8  0.000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  30.72 
 
 		 180 aa  52.8  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7541  hypothetical protein  24.68 
 
 		 240 aa  52.4  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  36.54 
 
 		 324 aa  52.4  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.69 
 
 		 158 aa  52  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  30.47 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  30.4 
 
 		 240 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  27.71 
 
 		 183 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  30.47 
 
 		 214 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  32.37 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.33 
 
 		 258 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  32.64 
 
 		 271 aa  50.4  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.81 
 
 		 148 aa  50.4  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  32.56 
 
 		 185 aa  50.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  27.78 
 
 		 184 aa  50.1  0.00004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 192 aa  49.7  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  34.62 
 
 		 323 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.92 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  30.47 
 
 		 155 aa  49.3  0.00006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.47 
 
 		 192 aa  49.3  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.44 
 
 		 180 aa  48.9  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  33.07 
 
 		 175 aa  48.9  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  29.3 
 
 		 185 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  28.03 
 
 		 187 aa  48.9  0.00009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  31.86 
 
 		 169 aa  48.5  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  35.16 
 
 		 190 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  27.11 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  32.09 
 
 		 162 aa  47.8  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  39.58 
 
 		 154 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>