107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0454 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  27.63 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  25.61 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  26.38 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  30.3 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.08 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.77 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  27.06 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  26.57 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.08 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  25.77 
 
 		 183 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.59 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  24.11 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  29.23 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  24.34 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  24.34 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  27.56 
 
 		 153 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  31.34 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  31.34 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  27.57 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.36 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.59 
 
 		 161 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  27.45 
 
 		 175 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  32.09 
 
 		 273 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  29.27 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00242  transcription factor (Snd1/p100), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09250)  30.09 
 
 		 882 aa  52.4  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  28.12 
 
 		 232 aa  52.4  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.01 
 
 		 184 aa  52.4  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.39 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  25.36 
 
 		 166 aa  51.6  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.62 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  25.58 
 
 		 148 aa  51.6  0.000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  29.13 
 
 		 169 aa  51.6  0.000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  29.46 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  31.58 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  26.98 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  28.68 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  30.71 
 
 		 136 aa  50.4  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 249 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  25 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  29.23 
 
 		 255 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 226 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  28.57 
 
 		 263 aa  49.7  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  29.17 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  26.47 
 
 		 237 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  32.06 
 
 		 273 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  30.77 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.37 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 157 aa  49.3  0.00004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30.47 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  31.65 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  26.4 
 
 		 150 aa  48.5  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.33 
 
 		 534 aa  48.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  30.3 
 
 		 255 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  26.09 
 
 		 282 aa  47.8  0.00009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  23.7 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  30.47 
 
 		 224 aa  47.4  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  29.82 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  28.97 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  27.46 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  31.07 
 
 		 170 aa  47  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  25.71 
 
 		 327 aa  46.6  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  25 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  25.2 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  26.77 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  27.82 
 
 		 175 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  26.52 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  30.16 
 
 		 153 aa  45.4  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  29.1 
 
 		 168 aa  45.4  0.0005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  27.89 
 
 		 182 aa  45.4  0.0006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  27.15 
 
 		 273 aa  45.1  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  29.63 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  25.19 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  23.97 
 
 		 166 aa  44.7  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  26.35 
 
 		 272 aa  44.7  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.55 
 
 		 273 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.46 
 
 		 153 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  28.68 
 
 		 153 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  28.86 
 
 		 164 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  26.98 
 
 		 284 aa  43.5  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  25.53 
 
 		 164 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  35.58 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  26.77 
 
 		 153 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  25.2 
 
 		 138 aa  43.9  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  32.09 
 
 		 372 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  26.16 
 
 		 260 aa  42.7  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  33.01 
 
 		 146 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.85 
 
 		 157 aa  42.4  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  23.88 
 
 		 197 aa  42.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  27.14 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  25.19 
 
 		 227 aa  42  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  23.4 
 
 		 266 aa  42.4  0.005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 158 aa  42.4  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  24.82 
 
 		 351 aa  42  0.005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  24.11 
 
 		 276 aa  42  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.01 
 
 		 211 aa  42  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>