178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2377 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  100 
 
 		 185 aa  374  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  61.81 
 
 		 187 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  41.53 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  44.08 
 
 		 187 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  46.41 
 
 		 169 aa  136  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  46.1 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  47.59 
 
 		 171 aa  131  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  44.44 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  43.04 
 
 		 171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  42.21 
 
 		 148 aa  115  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  41.38 
 
 		 180 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  38.3 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.9 
 
 		 174 aa  102  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  39.71 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  39.31 
 
 		 216 aa  100  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  37.68 
 
 		 232 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  39.19 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  35.51 
 
 		 153 aa  97.4  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  36.91 
 
 		 227 aa  97.1  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  36 
 
 		 199 aa  97.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  36.96 
 
 		 182 aa  94.7  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  37.74 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 238 aa  92  4e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  40 
 
 		 196 aa  91.7  6e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  31.41 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  38.31 
 
 		 169 aa  89.4  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.94 
 
 		 175 aa  88.6  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.34 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.78 
 
 		 193 aa  87.8  7e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  40.58 
 
 		 153 aa  87.8  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.34 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  35.62 
 
 		 150 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  30.37 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.48 
 
 		 166 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  34.56 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  38.13 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  36.18 
 
 		 157 aa  81.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.5 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  38.13 
 
 		 153 aa  81.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  35.42 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  42.36 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  40.43 
 
 		 162 aa  79  0.00000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.41 
 
 		 153 aa  77.4  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  32.05 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  31.25 
 
 		 227 aa  76.3  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.05 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.03 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  39.31 
 
 		 168 aa  73.9  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  32.73 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.5 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  29.32 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  29.32 
 
 		 214 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  32.48 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  29.63 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.1 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  32.61 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  30.56 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  37.59 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.82 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  30.97 
 
 		 187 aa  68.6  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  38.03 
 
 		 161 aa  67.8  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  33.78 
 
 		 183 aa  67  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  38.13 
 
 		 175 aa  67  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  34.35 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  35.97 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 178 aa  63.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.15 
 
 		 169 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.47 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.25 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.43 
 
 		 138 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  34.31 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 171 aa  62  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.33 
 
 		 233 aa  61.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.93 
 
 		 225 aa  61.2  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  34.06 
 
 		 200 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  35.48 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.77 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  29.5 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  28.57 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.62 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  28.57 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.13 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.13 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  30.5 
 
 		 247 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  27.57 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.71 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  30.25 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  27.17 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.19 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  27.52 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  33.13 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  27.87 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.56 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.56 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>