101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_51840 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_51840  nuclease  100 
 
 		 185 aa  377  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  45.56 
 
 		 225 aa  161  6e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  45.26 
 
 		 150 aa  125  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  44.52 
 
 		 175 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  41.45 
 
 		 208 aa  100  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  41.86 
 
 		 156 aa  99.4  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  36.97 
 
 		 216 aa  98.6  5e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  37.5 
 
 		 138 aa  97.8  9e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  38 
 
 		 157 aa  97.4  1e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  38.85 
 
 		 196 aa  96.7  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  40.31 
 
 		 153 aa  95.9  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  40.46 
 
 		 169 aa  95.9  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.37 
 
 		 238 aa  94.7  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  37.09 
 
 		 153 aa  94.4  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.18 
 
 		 164 aa  94.4  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  34.87 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.57 
 
 		 148 aa  94  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  40 
 
 		 153 aa  91.7  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.54 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  30.77 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.18 
 
 		 244 aa  87  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  30.12 
 
 		 162 aa  85.5  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.5 
 
 		 185 aa  81.3  0.000000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.97 
 
 		 166 aa  81.3  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  32.85 
 
 		 228 aa  80.9  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.85 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.48 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.22 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.76 
 
 		 227 aa  78.6  0.00000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  31.85 
 
 		 175 aa  78.2  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.86 
 
 		 171 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.85 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  34.72 
 
 		 193 aa  77  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.64 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.07 
 
 		 182 aa  73.6  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 161 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  31.51 
 
 		 175 aa  73.9  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.99 
 
 		 153 aa  72.4  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  34.97 
 
 		 168 aa  71.6  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  25.99 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.3 
 
 		 233 aa  71.2  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  29.68 
 
 		 169 aa  70.5  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  34.65 
 
 		 171 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.65 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.14 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  27.63 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 		 158 aa  67.8  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.32 
 
 		 187 aa  67.8  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.13 
 
 		 179 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  26.26 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  28.99 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  34.35 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.46 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.33 
 
 		 187 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.66 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.71 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.31 
 
 		 226 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  34.65 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 266 aa  58.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  36.61 
 
 		 178 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  29.8 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  25.56 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  29.49 
 
 		 179 aa  56.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  25.74 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  30.06 
 
 		 165 aa  53.9  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  32.02 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  34.01 
 
 		 171 aa  52.4  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  32.23 
 
 		 142 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  28.38 
 
 		 282 aa  51.2  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  27.64 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  30.39 
 
 		 163 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  34.21 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  27.27 
 
 		 166 aa  47.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  25.42 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  30.26 
 
 		 185 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  30.2 
 
 		 301 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.82 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  26.77 
 
 		 192 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  30.16 
 
 		 168 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  25.35 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  25.9 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28560  hypothetical protein  30.77 
 
 		 172 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000400321 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  31.3 
 
 		 214 aa  45.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  31.18 
 
 		 241 aa  45.4  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  26.32 
 
 		 157 aa  44.7  0.0007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  28.89 
 
 		 227 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  27.34 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  24.14 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  28.95 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  28 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2491  hypothetical protein  33.75 
 
 		 173 aa  42.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  29.85 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  27.48 
 
 		 284 aa  42  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.37 
 
 		 211 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  27.88 
 
 		 212 aa  42  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  25.34 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  27.41 
 
 		 161 aa  41.6  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>