155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_47870 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  100 
 
 		 225 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  45.56 
 
 		 185 aa  161  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  37.84 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  38.92 
 
 		 196 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  45.27 
 
 		 175 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  45.52 
 
 		 138 aa  128  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  43.17 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  42.22 
 
 		 150 aa  121  8e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  38.93 
 
 		 153 aa  111  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  38.93 
 
 		 153 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  36.77 
 
 		 148 aa  108  5e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  39.86 
 
 		 153 aa  105  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.65 
 
 		 164 aa  105  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  40.51 
 
 		 157 aa  105  8e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  45.31 
 
 		 169 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.86 
 
 		 153 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  35.95 
 
 		 185 aa  100  1e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  36.88 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.8 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 		 153 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  39.1 
 
 		 156 aa  99.8  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  37.4 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  40 
 
 		 208 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  35.85 
 
 		 228 aa  98.6  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 		 221 aa  98.6  7e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.01 
 
 		 244 aa  92.4  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  34.64 
 
 		 193 aa  90.9  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  36.88 
 
 		 171 aa  89.4  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  32.24 
 
 		 184 aa  89  5e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.72 
 
 		 166 aa  89  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.33 
 
 		 174 aa  87.8  1e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  37.69 
 
 		 161 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 175 aa  87.8  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  34.42 
 
 		 227 aa  86.7  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 169 aa  86.7  3e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.32 
 
 		 206 aa  86.3  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.81 
 
 		 192 aa  84.3  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  34.39 
 
 		 162 aa  81.3  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  30.83 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.79 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.33 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  28.87 
 
 		 227 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.95 
 
 		 180 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  29.81 
 
 		 182 aa  77  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  32.43 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.26 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.61 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  31.61 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.76 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.46 
 
 		 171 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.72 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.27 
 
 		 158 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  38.3 
 
 		 169 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  41.46 
 
 		 161 aa  72  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  33.96 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.94 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.03 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  34.56 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  35.94 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  30.56 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  34.56 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.72 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.93 
 
 		 185 aa  62  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.53 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.52 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1410  cold-shock protein, DNA-binding  54.76 
 
 		 66 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  34.33 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  58.54 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.14 
 
 		 161 aa  59.7  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  29.19 
 
 		 164 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0396  hypothetical protein  52.27 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.74 
 
 		 177 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  42.31 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.14 
 
 		 185 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0693  hypothetical protein  52.5 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  30.69 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4786  putative cold-shock protein, DNA-binding  52.08 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548437  normal  0.675436 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.41 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  30.77 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  29.85 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  55.56 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  37.5 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3678  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1841  Excalibur domain protein  43.75 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  37.93 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1486  cold-shock protein  41.67 
 
 		 176 aa  55.5  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0733  cold shock domain-contain protein  56.76 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.45 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  28.79 
 
 		 163 aa  54.7  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0680  cold-shock DNA-binding domain protein  54.05 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  50 
 
 		 217 aa  54.7  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0689  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.05 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.1 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  35.76 
 
 		 240 aa  53.9  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>