35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0396 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_0396  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  283  8e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3705  Excalibur domain-containing protein  82.22 
 
 		 97 aa  86.7  9e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1841  Excalibur domain protein  57.58 
 
 		 102 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2336  hypothetical protein  71.11 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.900928  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4616  hypothetical protein  63.27 
 
 		 231 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.825297 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.41 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1911  hypothetical protein  68.42 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357462  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0693  hypothetical protein  67.5 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  64.29 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  59.09 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  65.85 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1043  hypothetical protein  70 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355222  normal  0.453598 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  51.52 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  63.41 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1486  cold-shock protein  53.33 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  60.98 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0733  cold shock domain-contain protein  47.17 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  52.27 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4295  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  60.98 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.82 
 
 		 203 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4786  putative cold-shock protein, DNA-binding  27.91 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548437  normal  0.675436 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.27 
 
 		 217 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  57.14 
 
 		 185 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0680  cold-shock DNA-binding domain protein  56.1 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0689  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  56.1 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0580  cold-shock DNA-binding protein family protein  58.54 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  45.1 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3678  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  52.38 
 
 		 188 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0441  cold-shock protein, DNA-binding  53.66 
 
 		 239 aa  52.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249195  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01686  cold shock domain protein  47.62 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.711044  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.78 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2624  hypothetical protein  65.52 
 
 		 34 aa  47  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  39.58 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1410  cold-shock protein, DNA-binding  46.15 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>