36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1410 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1410  cold-shock protein, DNA-binding  100 
 
 		 66 aa  131  3.9999999999999996e-30  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  58.14 
 
 		 216 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  54.76 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  56.1 
 
 		 196 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0441  cold-shock protein, DNA-binding  54.05 
 
 		 239 aa  50.4  0.000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00249195  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  44.9 
 
 		 204 aa  49.7  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1304  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  45.65 
 
 		 201 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.366521  normal  0.14728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4295  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  57.14 
 
 		 206 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0647  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.29 
 
 		 217 aa  47.8  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0485  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.29 
 
 		 205 aa  47  0.00008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0693  hypothetical protein  52.63 
 
 		 143 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3355  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.72 
 
 		 193 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0537  cold-shock DNA-binding protein family protein  40.43 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120085  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3697  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  47.22 
 
 		 203 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0545  cold-shock DNA-binding domain protein  50 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.803384  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4786  putative cold-shock protein, DNA-binding  47.5 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.548437  normal  0.675436 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3544  cold-shock DNA-binding protein family protein  44.68 
 
 		 192 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3103  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.72 
 
 		 186 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0104717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0733  cold shock domain-contain protein  47.22 
 
 		 203 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2336  hypothetical protein  46.15 
 
 		 111 aa  43.9  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.900928  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0396  hypothetical protein  46.15 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.713289  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0580  cold-shock DNA-binding protein family protein  51.43 
 
 		 197 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0689  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.0009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0659  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  48.57 
 
 		 217 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3678  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  54.29 
 
 		 188 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0680  cold-shock DNA-binding domain protein  48.57 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1911  hypothetical protein  44.19 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.357462  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1841  Excalibur domain protein  46.15 
 
 		 102 aa  43.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0158  cell surface protein  34.72 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000260772  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1043  hypothetical protein  42.11 
 
 		 156 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0355222  normal  0.453598 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4318  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.11 
 
 		 195 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0130  lpxtg-motif cell wall anchor domain protein  36.11 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000579008 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0875  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  34.48 
 
 		 177 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.377088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1486  cold-shock protein  50 
 
 		 176 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00940094  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4616  hypothetical protein  41.03 
 
 		 231 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.825297 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3373  cold-shock DNA-binding protein family protein  48.57 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>