172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0594 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  100 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  77 
 
 		 212 aa  316  1e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  42.66 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  38.95 
 
 		 227 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  38.42 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  45.65 
 
 		 534 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  46.41 
 
 		 227 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  45.33 
 
 		 161 aa  126  3e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  41.83 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  45.22 
 
 		 158 aa  115  5e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  40.26 
 
 		 167 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  44.68 
 
 		 172 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  40.38 
 
 		 166 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  39.22 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  37.25 
 
 		 242 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  35.8 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  45.38 
 
 		 226 aa  102  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  39.1 
 
 		 176 aa  102  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  44.62 
 
 		 214 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  35.62 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  42.86 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  35.88 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  35.46 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  35.46 
 
 		 189 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 358 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  37.25 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  34.64 
 
 		 241 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  39.35 
 
 		 202 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  34.27 
 
 		 184 aa  92  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  35.51 
 
 		 177 aa  87  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  36.67 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  34.06 
 
 		 177 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  34.06 
 
 		 177 aa  86.3  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  41.13 
 
 		 163 aa  85.9  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 208 aa  85.1  6e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  38.81 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  42.07 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  44.12 
 
 		 158 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.1 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  37.58 
 
 		 175 aa  82.8  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.49 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.49 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  35.33 
 
 		 250 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  36.72 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  31.52 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  36.72 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.62 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  29.87 
 
 		 148 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  66.67 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  32.9 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  66.67 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  32.9 
 
 		 319 aa  70.5  0.00000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  66.67 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  66.67 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  66.67 
 
 		 287 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  66.67 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.99 
 
 		 179 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  80 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  66.67 
 
 		 318 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 		 158 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  64.29 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.9 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  31.33 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  32.81 
 
 		 171 aa  68.2  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  61.54 
 
 		 382 aa  67.8  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.11 
 
 		 174 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  34.75 
 
 		 329 aa  68.2  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.56 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.1 
 
 		 168 aa  64.7  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  63.41 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  50.94 
 
 		 334 aa  64.3  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  27.68 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.91 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  61.11 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  28.83 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  37.19 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  31.85 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  28.86 
 
 		 231 aa  59.3  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  25.59 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.18 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  29.41 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2181  Excalibur domain-containing protein  36.59 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.16 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0301  Excalibur domain protein  74.42 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1214  putative CheA signal transduction histidine kinase  62.16 
 
 		 349 aa  56.2  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2296  NLP/P60 protein  45.74 
 
 		 625 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000910624  hitchhiker  0.00399846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  26.67 
 
 		 156 aa  55.5  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  26.9 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02630  protein of unknown function (DUF1994)  63.89 
 
 		 389 aa  54.7  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.91242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.38 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.17 
 
 		 157 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.96 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.17 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.56 
 
 		 171 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  27.95 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  32.19 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>