176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0658 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 171 aa  356  9.999999999999999e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  40.4 
 
 		 153 aa  121  5e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  39.74 
 
 		 153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  41.98 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  38.92 
 
 		 244 aa  112  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  42.86 
 
 		 216 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  41.73 
 
 		 206 aa  108  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  38.61 
 
 		 185 aa  108  3e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  38.31 
 
 		 153 aa  108  5e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  45 
 
 		 227 aa  107  6e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  40 
 
 		 153 aa  107  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  39.86 
 
 		 164 aa  104  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  46.56 
 
 		 148 aa  103  9e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  39.84 
 
 		 238 aa  102  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  39.72 
 
 		 175 aa  102  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  40.88 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.52 
 
 		 169 aa  102  4e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  40.43 
 
 		 184 aa  98.6  4e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  39.52 
 
 		 232 aa  97.4  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  36.42 
 
 		 175 aa  97.1  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  36.42 
 
 		 175 aa  96.3  2e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  35.8 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  38.19 
 
 		 162 aa  94.7  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.83 
 
 		 199 aa  94.4  8e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.54 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.72 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.21 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  34.57 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  35.22 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.76 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  37.31 
 
 		 174 aa  88.6  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.3 
 
 		 192 aa  88.2  5e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  34.13 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.34 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.53 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.74 
 
 		 182 aa  85.1  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.81 
 
 		 183 aa  84  9e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 163 aa  83.2  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  35.71 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  35.92 
 
 		 187 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  32.35 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  37.4 
 
 		 150 aa  82  0.000000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  33.11 
 
 		 205 aa  82  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.48 
 
 		 187 aa  80.1  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.13 
 
 		 171 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  36.62 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  30.46 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  35.21 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  35.34 
 
 		 169 aa  78.6  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.3 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  37.04 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  32.41 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.72 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.39 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  34.65 
 
 		 185 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  35.86 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.86 
 
 		 158 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  28.14 
 
 		 167 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  33.83 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 233 aa  68.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  33.96 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  35.11 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  29.87 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  33.78 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25.14 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  31.17 
 
 		 240 aa  62  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  30.67 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  30.67 
 
 		 171 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  27.07 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  27.81 
 
 		 226 aa  60.8  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  28.48 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  29.38 
 
 		 231 aa  60.8  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  34 
 
 		 169 aa  60.1  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  27.66 
 
 		 388 aa  59.7  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  29.65 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  28.78 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  28.19 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  26.52 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  27.17 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.38 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 		 333 aa  57.4  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  27.89 
 
 		 166 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  29.88 
 
 		 334 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  31.58 
 
 		 350 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  29.38 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  29.01 
 
 		 346 aa  55.5  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  29.85 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.07 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.94 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.15 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  27.27 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  29.65 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  31.58 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  26.39 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  30.71 
 
 		 258 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.27 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>