50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45339 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  100 
 
 		 334 aa  686    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  41.81 
 
 		 164 aa  100  3e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  32.21 
 
 		 235 aa  90.5  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.39353 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  31.22 
 
 		 282 aa  87  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  30.85 
 
 		 280 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.32 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.14 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.72 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.61 
 
 		 187 aa  54.7  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  31.01 
 
 		 193 aa  55.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  28.42 
 
 		 187 aa  53.5  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.33 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.94 
 
 		 185 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  32.2 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  27.48 
 
 		 169 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  27.65 
 
 		 179 aa  51.2  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.41 
 
 		 175 aa  50.1  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.41 
 
 		 175 aa  49.7  0.00006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.23 
 
 		 171 aa  49.3  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  28.24 
 
 		 183 aa  49.7  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  31.48 
 
 		 175 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 		 146 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  27.68 
 
 		 178 aa  48.5  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.47 
 
 		 221 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  31.09 
 
 		 184 aa  48.5  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2807  nuclease (SNase-like)  29.65 
 
 		 178 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00150481  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  27.33 
 
 		 171 aa  47  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  33.61 
 
 		 221 aa  46.6  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.09 
 
 		 227 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.68 
 
 		 180 aa  47  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  29.01 
 
 		 190 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  29.01 
 
 		 190 aa  46.6  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.63 
 
 		 168 aa  46.6  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  31.11 
 
 		 189 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  29.31 
 
 		 205 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  30.69 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  32 
 
 		 267 aa  44.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  28.83 
 
 		 388 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  36.08 
 
 		 179 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  27.13 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  25.61 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  31.31 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  24.55 
 
 		 263 aa  44.7  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  30.3 
 
 		 273 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  24.69 
 
 		 183 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  25.95 
 
 		 227 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  26.62 
 
 		 225 aa  43.5  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  31.96 
 
 		 237 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  26.09 
 
 		 174 aa  42.7  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  28.28 
 
 		 255 aa  42.7  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>