209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2526 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  100 
 
 		 171 aa  345  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  52.6 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  46.55 
 
 		 179 aa  153  9e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  43.45 
 
 		 187 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  47.59 
 
 		 169 aa  148  3e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  44.83 
 
 		 183 aa  142  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  49.66 
 
 		 158 aa  141  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  38.95 
 
 		 180 aa  129  3e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  43.04 
 
 		 185 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  38.07 
 
 		 193 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  41.55 
 
 		 187 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  38.07 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  36.88 
 
 		 174 aa  106  2e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  33.33 
 
 		 244 aa  105  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.53 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 206 aa  102  2e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  37.27 
 
 		 185 aa  101  4e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.24 
 
 		 199 aa  100  9e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  41.26 
 
 		 182 aa  100  9e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.92 
 
 		 175 aa  98.6  4e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.31 
 
 		 175 aa  98.2  5e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.93 
 
 		 227 aa  97.4  8e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.31 
 
 		 175 aa  96.7  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  34.36 
 
 		 221 aa  97.1  1e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  35.81 
 
 		 216 aa  96.3  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  37.76 
 
 		 171 aa  96.3  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.58 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  33.95 
 
 		 221 aa  95.5  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  39.72 
 
 		 196 aa  95.1  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.55 
 
 		 148 aa  94.4  8e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.67 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.56 
 
 		 153 aa  94  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.86 
 
 		 153 aa  92.4  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.26 
 
 		 193 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 171 aa  91.3  6e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.97 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  36.54 
 
 		 166 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  37.09 
 
 		 162 aa  89  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 238 aa  87  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 169 aa  85.9  2e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.11 
 
 		 153 aa  84.3  8e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.13 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.2 
 
 		 164 aa  81.6  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  37.67 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  34.81 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  29.94 
 
 		 183 aa  80.1  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.12 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  39.2 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  30.91 
 
 		 191 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.72 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.9 
 
 		 175 aa  75.1  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  30.3 
 
 		 205 aa  74.3  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  29.93 
 
 		 161 aa  72  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.63 
 
 		 166 aa  71.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  33.56 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  29.7 
 
 		 157 aa  70.1  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  26.95 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.5 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  35.21 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  32.14 
 
 		 168 aa  67  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  32.32 
 
 		 256 aa  67  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  37.01 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  30.23 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.82 
 
 		 350 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  30.23 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.81 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  35.37 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  28.11 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  30.06 
 
 		 166 aa  64.7  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  30.56 
 
 		 178 aa  64.3  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  35.66 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.55 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  34.68 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  27.7 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  25 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  36.17 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  30.43 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  30 
 
 		 258 aa  63.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.83 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  29.52 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  33.58 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  29.88 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  28.65 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.9 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  30.94 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.87 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  28.65 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.09 
 
 		 266 aa  62  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  29.94 
 
 		 225 aa  62  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.39 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  35.51 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  27.78 
 
 		 267 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  29.21 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  35.9 
 
 		 179 aa  60.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  32.59 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  30.07 
 
 		 167 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  31.72 
 
 		 346 aa  60.1  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  29.27 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  32 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  35.2 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>