115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5017 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  100 
 
 		 167 aa  331  3e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  52.94 
 
 		 227 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  52.94 
 
 		 227 aa  156  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  54.93 
 
 		 227 aa  149  1e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  52.14 
 
 		 208 aa  143  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  53.73 
 
 		 211 aa  134  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  52.99 
 
 		 209 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  48.15 
 
 		 177 aa  124  8.000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  43.45 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  43.45 
 
 		 177 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  41.25 
 
 		 221 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  40.26 
 
 		 211 aa  114  3.9999999999999997e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  42.55 
 
 		 212 aa  114  5e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  45.19 
 
 		 192 aa  110  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  45.04 
 
 		 214 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  44.27 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  42.03 
 
 		 214 aa  105  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  42.57 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  42.57 
 
 		 189 aa  104  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  39.47 
 
 		 171 aa  102  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  41.13 
 
 		 172 aa  101  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  45 
 
 		 161 aa  101  4e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  40.74 
 
 		 534 aa  100  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  38.71 
 
 		 158 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  41.18 
 
 		 242 aa  95.5  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  36.36 
 
 		 220 aa  94.4  6e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 		 358 aa  93.6  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  37.41 
 
 		 241 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  36.36 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  39.07 
 
 		 166 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  37.33 
 
 		 202 aa  88.2  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  41.18 
 
 		 243 aa  88.2  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 226 aa  87.4  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  36.76 
 
 		 242 aa  85.5  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  34.56 
 
 		 184 aa  84  9e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  41.38 
 
 		 163 aa  82.8  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  33.83 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  36.64 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  36.03 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  43.88 
 
 		 158 aa  77.4  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  37.43 
 
 		 179 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  28.66 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.33 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  45.11 
 
 		 192 aa  72  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.56 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.92 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.28 
 
 		 175 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  34.62 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  33.56 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  36.57 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.13 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.17 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.51 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  35.26 
 
 		 250 aa  63.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  33.58 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  37.14 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.48 
 
 		 246 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  35.94 
 
 		 246 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.89 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  26.71 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3714  nuclease (SNase-like)  31.67 
 
 		 156 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  30.2 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.06 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  36.47 
 
 		 319 aa  55.5  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  36.47 
 
 		 319 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  31.61 
 
 		 183 aa  53.5  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  32.62 
 
 		 168 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  28.28 
 
 		 153 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.45 
 
 		 192 aa  53.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  35.48 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  29.85 
 
 		 170 aa  52.4  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  35.29 
 
 		 329 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  32.54 
 
 		 170 aa  52  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.07 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  30.51 
 
 		 131 aa  51.6  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  30.86 
 
 		 199 aa  50.8  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.57 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  27.65 
 
 		 175 aa  50.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  28.48 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  27.59 
 
 		 153 aa  50.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  35.05 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  32.76 
 
 		 136 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  30.25 
 
 		 175 aa  48.9  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  30.43 
 
 		 815 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  25.17 
 
 		 153 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  30.83 
 
 		 423 aa  47  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  31.91 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  28.26 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  29.93 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.87 
 
 		 164 aa  46.2  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.25 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.25 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 		 134 aa  45.1  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  30.83 
 
 		 430 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  29.03 
 
 		 407 aa  44.7  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.5 
 
 		 256 aa  44.3  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  31.71 
 
 		 436 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.29 
 
 		 169 aa  44.3  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  31.71 
 
 		 436 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>