179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1682 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 153 aa  303  5.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  47.71 
 
 		 216 aa  144  5e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  43.05 
 
 		 153 aa  138  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  52.55 
 
 		 150 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  43.62 
 
 		 156 aa  125  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  44.67 
 
 		 153 aa  124  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  44.44 
 
 		 153 aa  122  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  44.3 
 
 		 232 aa  122  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  41.25 
 
 		 175 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  42.95 
 
 		 244 aa  120  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  41.89 
 
 		 157 aa  119  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  47.69 
 
 		 196 aa  116  9e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  44.72 
 
 		 185 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  40.52 
 
 		 164 aa  113  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  41.67 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  43.14 
 
 		 227 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  44.12 
 
 		 171 aa  112  3e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  38.78 
 
 		 228 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  38 
 
 		 206 aa  111  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  41.94 
 
 		 162 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  39.47 
 
 		 221 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  41.03 
 
 		 166 aa  107  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  38.82 
 
 		 221 aa  106  9.000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  41.89 
 
 		 148 aa  106  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  38.79 
 
 		 225 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  35.57 
 
 		 169 aa  105  2e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  41.78 
 
 		 191 aa  105  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  41.78 
 
 		 205 aa  104  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  35.06 
 
 		 174 aa  104  4e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  36.84 
 
 		 171 aa  104  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  34.69 
 
 		 175 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  34.01 
 
 		 175 aa  103  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  35.67 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  33.33 
 
 		 175 aa  101  4e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  37.6 
 
 		 184 aa  101  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  36.51 
 
 		 192 aa  97.4  6e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  41.67 
 
 		 171 aa  95.9  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.33 
 
 		 153 aa  92.8  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.3 
 
 		 138 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.19 
 
 		 161 aa  92.4  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  38.16 
 
 		 185 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  41.18 
 
 		 187 aa  92  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  38.95 
 
 		 185 aa  91.7  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  40.12 
 
 		 168 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  33.33 
 
 		 199 aa  91.7  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  37.5 
 
 		 180 aa  91.3  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  38.73 
 
 		 179 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  33.8 
 
 		 166 aa  90.9  6e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  39.74 
 
 		 171 aa  89  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  36.81 
 
 		 187 aa  87.8  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  39.58 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  37.13 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  40.13 
 
 		 194 aa  85.5  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  41.61 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  39.55 
 
 		 227 aa  84  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  31.78 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  39.84 
 
 		 169 aa  82  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  36.88 
 
 		 183 aa  80.9  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  38.93 
 
 		 155 aa  79  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  36.11 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  32.35 
 
 		 157 aa  77.8  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  33.11 
 
 		 167 aa  77  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 158 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  41.18 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  43.18 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.84 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38.97 
 
 		 214 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  34.72 
 
 		 179 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  40 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  34.25 
 
 		 171 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.2 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  38.85 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.32 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  38.85 
 
 		 227 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  28.32 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  33.56 
 
 		 158 aa  65.5  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  34.93 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  34.81 
 
 		 212 aa  64.7  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  38.33 
 
 		 227 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.21 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  33.56 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  32.5 
 
 		 259 aa  62.4  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  36.49 
 
 		 178 aa  62  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.33 
 
 		 171 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  27.59 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  27.59 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  27.12 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30.83 
 
 		 184 aa  60.8  0.000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  34.59 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  34.59 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.69 
 
 		 221 aa  60.5  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  32.08 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  32.08 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  33.82 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  34.67 
 
 		 167 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  27.38 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  33.58 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  36.8 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  37.6 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>