161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2046 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  100 
 
 
233 aa  478  1e-134  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  36.91 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  44.38 
 
 
183 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  35.09 
 
 
221 aa  112  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  33.91 
 
 
221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.59 
 
 
162 aa  108  6e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.5 
 
 
175 aa  105  8e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31.49 
 
 
225 aa  102  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  35.85 
 
 
155 aa  97.8  1e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32.56 
 
 
244 aa  96.7  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  34.76 
 
 
206 aa  93.2  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  28.88 
 
 
216 aa  90.9  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  30.29 
 
 
196 aa  90.9  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  34.53 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  34.53 
 
 
171 aa  87.4  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  34.59 
 
 
179 aa  87.4  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  34.94 
 
 
156 aa  87.4  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.82 
 
 
186 aa  86.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  34.21 
 
 
169 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.88 
 
 
232 aa  85.9  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.81 
 
 
148 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.95 
 
 
164 aa  84.3  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  33.97 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.71 
 
 
166 aa  83.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  30.23 
 
 
180 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30 
 
 
183 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  37.84 
 
 
171 aa  80.1  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  32.95 
 
 
187 aa  80.9  0.00000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  34.06 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  34.36 
 
 
185 aa  79.3  0.00000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  32.87 
 
 
150 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
162 aa  79.3  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 
238 aa  79  0.00000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.03 
 
 
153 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.52 
 
 
171 aa  78.2  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  34.13 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.88 
 
 
174 aa  77  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  30.77 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0288  Excalibur  37.5 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.03 
 
 
153 aa  75.5  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  38.02 
 
 
142 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.17 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  32.3 
 
 
157 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.26 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  28.34 
 
 
185 aa  72.8  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  27.75 
 
 
212 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.31 
 
 
187 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 
158 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  27.43 
 
 
168 aa  70.1  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  29.02 
 
 
227 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  29.2 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.92 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.12 
 
 
175 aa  68.2  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  28.78 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  31.58 
 
 
169 aa  68.2  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.31 
 
 
175 aa  67.8  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  28.5 
 
 
259 aa  67.4  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  29.33 
 
 
175 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  28.29 
 
 
161 aa  67  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.8 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  36.69 
 
 
214 aa  65.9  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  33.33 
 
 
408 aa  65.9  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  30.83 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  31.88 
 
 
192 aa  65.5  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  33.33 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  27.73 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  33.33 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  29.87 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  29.08 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.55 
 
 
185 aa  62.4  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  36.43 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  36.43 
 
 
214 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.74 
 
 
171 aa  62  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  34.26 
 
 
382 aa  61.2  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  32.09 
 
 
209 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  27.56 
 
 
178 aa  59.7  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  29.79 
 
 
214 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  30.83 
 
 
155 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  26.11 
 
 
165 aa  58.5  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  29.79 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  28.84 
 
 
231 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  26.47 
 
 
534 aa  58.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  28.48 
 
 
191 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  27.71 
 
 
182 aa  58.2  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  28.12 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  24.7 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  27.06 
 
 
161 aa  57.4  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  30.12 
 
 
227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  31.75 
 
 
266 aa  57  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  28.48 
 
 
205 aa  57  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  28.24 
 
 
258 aa  56.2  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  27.9 
 
 
220 aa  55.8  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  28.37 
 
 
214 aa  55.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  31.17 
 
 
192 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  29.38 
 
 
194 aa  55.5  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  26.43 
 
 
388 aa  55.1  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  31.06 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  29.56 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  26.58 
 
 
183 aa  54.3  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>