111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_41180 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_41180  nuclease  100 
 
 		 138 aa  283  7e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  62.12 
 
 		 167 aa  182  1.0000000000000001e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  45.52 
 
 		 225 aa  128  3e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  41.26 
 
 		 175 aa  120  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  38.17 
 
 		 150 aa  99.8  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  36.96 
 
 		 208 aa  98.6  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  37.5 
 
 		 185 aa  97.8  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  36.84 
 
 		 185 aa  96.7  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.11 
 
 		 238 aa  95.5  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  39.84 
 
 		 169 aa  93.6  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  37.12 
 
 		 232 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  36.3 
 
 		 153 aa  92  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  37.69 
 
 		 153 aa  89  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.92 
 
 		 153 aa  88.6  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 157 aa  88.6  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  37.12 
 
 		 148 aa  88.2  3e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  36.84 
 
 		 156 aa  88.6  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  36.15 
 
 		 161 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  36.5 
 
 		 169 aa  84.7  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  34.85 
 
 		 192 aa  84  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.06 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.33 
 
 		 183 aa  82.8  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  35.42 
 
 		 180 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 228 aa  80.5  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  34.06 
 
 		 233 aa  80.1  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  33.33 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.29 
 
 		 164 aa  78.2  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  34.09 
 
 		 174 aa  77.8  0.00000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.51 
 
 		 187 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 184 aa  77.8  0.00000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.33 
 
 		 216 aa  77.4  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  32.61 
 
 		 175 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  35.29 
 
 		 191 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  35.29 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  35.86 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  31.82 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.33 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.84 
 
 		 171 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.88 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  29.37 
 
 		 227 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  31.29 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.43 
 
 		 206 aa  72  0.000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.58 
 
 		 169 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  36.03 
 
 		 155 aa  70.1  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 153 aa  70.1  0.000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.15 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.88 
 
 		 221 aa  70.1  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  36.57 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.68 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  29.71 
 
 		 162 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  28.15 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  27.54 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 		 158 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  28.89 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  30.37 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  31.43 
 
 		 185 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  32.21 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  36.3 
 
 		 183 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  30.22 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  28.57 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  31.69 
 
 		 226 aa  57.4  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  32 
 
 		 161 aa  57  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.91 
 
 		 175 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.13 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  33.07 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.13 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  26.67 
 
 		 134 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  32.59 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  32.59 
 
 		 214 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  32.59 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  30.3 
 
 		 175 aa  53.5  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  30.66 
 
 		 175 aa  51.2  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  32.12 
 
 		 190 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  31.39 
 
 		 171 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  31.11 
 
 		 228 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  29.05 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  29.05 
 
 		 193 aa  49.7  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  30.83 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  25.49 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  31.03 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  35.42 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  35.42 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  28.8 
 
 		 266 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  23.85 
 
 		 198 aa  46.2  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  28.1 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  33.33 
 
 		 284 aa  45.4  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  23.78 
 
 		 192 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.15 
 
 		 202 aa  43.9  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  27.54 
 
 		 278 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  27.78 
 
 		 178 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  25.2 
 
 		 192 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  30.83 
 
 		 189 aa  42.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  30.59 
 
 		 169 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  30.83 
 
 		 189 aa  42.7  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  26.92 
 
 		 258 aa  42.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  30.93 
 
 		 382 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.71 
 
 		 221 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3167  nuclease  35.11 
 
 		 122 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>