57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_0135 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007413  Ava_0135  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 142 aa  286  6e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000156916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  41.86 
 
 		 227 aa  110  9e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  40.48 
 
 		 183 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  36.69 
 
 		 171 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  36.69 
 
 		 171 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  37.6 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  32.77 
 
 		 162 aa  70.1  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  31.97 
 
 		 155 aa  62.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  32.41 
 
 		 187 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  32.88 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  32.19 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.59 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  28.57 
 
 		 157 aa  57  0.00000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  30.88 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  32.23 
 
 		 185 aa  51.6  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 179 aa  51.6  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  28.57 
 
 		 244 aa  51.2  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  26.62 
 
 		 189 aa  51.2  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.85 
 
 		 232 aa  50.8  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.86 
 
 		 183 aa  50.4  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  26.62 
 
 		 183 aa  50.4  0.000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 158 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0288  Excalibur  48.94 
 
 		 114 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  36.5 
 
 		 200 aa  50.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  33.09 
 
 		 175 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.29 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  27.27 
 
 		 227 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  31.06 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  31.71 
 
 		 169 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.3 
 
 		 175 aa  48.1  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.55 
 
 		 175 aa  47.8  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  29.32 
 
 		 187 aa  47.4  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  30.47 
 
 		 185 aa  47.4  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.08 
 
 		 166 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  28.91 
 
 		 169 aa  47  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  30.37 
 
 		 187 aa  46.2  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.55 
 
 		 175 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  26.06 
 
 		 169 aa  46.6  0.0001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  32.06 
 
 		 150 aa  45.4  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  28.93 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  28.1 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  26.21 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.47 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  30.37 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32 
 
 		 171 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  29.63 
 
 		 186 aa  44.7  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 134 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  30.88 
 
 		 171 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  29.01 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  30.16 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  32.67 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  27.01 
 
 		 209 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  26.8 
 
 		 301 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  31.25 
 
 		 288 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0881  nuclease (SNase-like)  28.39 
 
 		 267 aa  41.6  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.456641  normal  0.074373 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 		 226 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>