194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0068 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  100 
 
 		 169 aa  349  1e-95  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  57.31 
 
 		 171 aa  206  9e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  45.51 
 
 		 179 aa  151  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  45.25 
 
 		 183 aa  151  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  49.33 
 
 		 158 aa  145  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  39.56 
 
 		 187 aa  140  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  47.62 
 
 		 185 aa  134  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  42.17 
 
 		 180 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  45.22 
 
 		 171 aa  127  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  40.51 
 
 		 232 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  44.06 
 
 		 187 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.58 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  39.74 
 
 		 193 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  35.85 
 
 		 244 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.67 
 
 		 171 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.73 
 
 		 192 aa  101  6e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  38.41 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  34.55 
 
 		 206 aa  99.4  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  40.56 
 
 		 196 aa  99  3e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.54 
 
 		 174 aa  97.8  6e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.58 
 
 		 148 aa  97.8  7e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  42.36 
 
 		 162 aa  96.3  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  36.03 
 
 		 153 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.8 
 
 		 162 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.73 
 
 		 182 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  34.52 
 
 		 227 aa  92.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 		 238 aa  92  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  35.53 
 
 		 216 aa  89.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  32.93 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  38.51 
 
 		 193 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.63 
 
 		 175 aa  88.6  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.01 
 
 		 175 aa  88.2  5e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.19 
 
 		 199 aa  87.8  7e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.4 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  36.03 
 
 		 185 aa  85.9  2e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  31.18 
 
 		 221 aa  85.9  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  41.61 
 
 		 153 aa  85.1  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  35.15 
 
 		 153 aa  84.7  6e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  33.57 
 
 		 221 aa  84.3  7e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  35.29 
 
 		 164 aa  83.6  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.91 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.82 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  33.75 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  33.78 
 
 		 184 aa  80.9  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  37.18 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  35 
 
 		 157 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  37.16 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  30.59 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.81 
 
 		 226 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  40.32 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.55 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 161 aa  77.8  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  36.31 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  36.69 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  37.65 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  34.59 
 
 		 155 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  33.95 
 
 		 167 aa  74.3  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  32.91 
 
 		 205 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  33.55 
 
 		 191 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  30.27 
 
 		 205 aa  70.9  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  33.58 
 
 		 138 aa  70.5  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.86 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.95 
 
 		 168 aa  68.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.58 
 
 		 233 aa  67.8  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  33.33 
 
 		 166 aa  68.2  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.79 
 
 		 187 aa  67.8  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  29.76 
 
 		 280 aa  66.6  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.01 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  32.86 
 
 		 134 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.72 
 
 		 158 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  31.82 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  29.11 
 
 		 164 aa  66.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.09 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.43 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  32.32 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  38.4 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  32.81 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  32.81 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  40.32 
 
 		 240 aa  63.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  39.31 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  27.45 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  34.97 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  34.93 
 
 		 227 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  33.73 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  37.16 
 
 		 208 aa  62  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  62  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  36.09 
 
 		 172 aa  61.6  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  35.86 
 
 		 273 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  36.3 
 
 		 273 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  35.88 
 
 		 350 aa  61.2  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  33.81 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  29.37 
 
 		 178 aa  60.8  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  35.86 
 
 		 255 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  37.01 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  35.56 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.88 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  30.77 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  35.88 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  28.19 
 
 		 157 aa  58.9  0.00000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>