160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0870 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  392  1e-108  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  64.29 
 
 		 221 aa  228  5e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  40.54 
 
 		 202 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  41.94 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  43.75 
 
 		 185 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  35.54 
 
 		 184 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  36.48 
 
 		 171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  42.17 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  45.52 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  38.42 
 
 		 358 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  42.38 
 
 		 167 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  43.33 
 
 		 227 aa  104  6e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  42.86 
 
 		 176 aa  101  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  34.78 
 
 		 220 aa  99.8  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  34.15 
 
 		 211 aa  98.6  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 241 aa  97.8  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  36.84 
 
 		 534 aa  95.5  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  42.34 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  40 
 
 		 242 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  37.68 
 
 		 171 aa  93.2  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  39.1 
 
 		 242 aa  92.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  41.67 
 
 		 163 aa  92  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  36.76 
 
 		 212 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  45.04 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  34.16 
 
 		 166 aa  90.5  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  39.52 
 
 		 214 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  39.69 
 
 		 161 aa  90.9  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  38.93 
 
 		 172 aa  90.1  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  38.64 
 
 		 241 aa  89.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  39.52 
 
 		 226 aa  88.2  6e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  34 
 
 		 158 aa  85.1  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  38.46 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  32.7 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  32.7 
 
 		 177 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.94 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  35.43 
 
 		 177 aa  81.6  0.000000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  37.4 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.95 
 
 		 168 aa  77  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  36.96 
 
 		 249 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.94 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  38.76 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.21 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.58 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  37.82 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  36.22 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.52 
 
 		 148 aa  68.9  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  37.8 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.61 
 
 		 153 aa  68.6  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  41.41 
 
 		 158 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  34.16 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.76 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  35.2 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  38.35 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.3 
 
 		 174 aa  65.1  0.0000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  27.65 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  36.29 
 
 		 169 aa  63.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.06 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.27 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.27 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  36.22 
 
 		 158 aa  62.8  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.9 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  36.75 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  26.67 
 
 		 175 aa  62  0.000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  31.71 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.56 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  38.71 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.38 
 
 		 185 aa  58.5  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  28.57 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  28.48 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  27.64 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.37 
 
 		 153 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  32.73 
 
 		 175 aa  55.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.99 
 
 		 166 aa  56.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.29 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  34.35 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 319 aa  54.7  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  27.33 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  33.33 
 
 		 319 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  30.08 
 
 		 157 aa  54.3  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.88 
 
 		 171 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  34.06 
 
 		 162 aa  53.1  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  32.04 
 
 		 169 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  31.43 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  28.57 
 
 		 153 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  29.37 
 
 		 281 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  32.59 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.25 
 
 		 166 aa  52.4  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  30.67 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  29.77 
 
 		 170 aa  52  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  32.18 
 
 		 329 aa  51.6  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  30.77 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  30.6 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  27.62 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  36.29 
 
 		 282 aa  50.1  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1600  thermonuclease family protein  25.76 
 
 		 307 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  26.42 
 
 		 167 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.77 
 
 		 175 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>