36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6222 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  30.13 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  28.65 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  27.5 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  29.93 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  33.57 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  27.33 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  27.33 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  27.66 
 
 		 168 aa  52.4  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  24.32 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  33.12 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  24.68 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  31.71 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  29.84 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  25.43 
 
 		 180 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.15 
 
 		 226 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  30.08 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  24.05 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.08 
 
 		 171 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  27.69 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  30.16 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  23.85 
 
 		 138 aa  46.2  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  27.97 
 
 		 171 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  30.16 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  28.06 
 
 		 231 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  27.86 
 
 		 158 aa  45.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  27.08 
 
 		 169 aa  44.7  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  22.29 
 
 		 184 aa  44.7  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  24.26 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  25.2 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  28.85 
 
 		 163 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  22.78 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  32.59 
 
 		 192 aa  42  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  29.79 
 
 		 227 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  26.83 
 
 		 169 aa  42  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>