37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4568 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009669  Oant_4568  nuclease  100 
 
 		 229 aa  468  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  68.66 
 
 		 233 aa  309  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  63.83 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  60.47 
 
 		 231 aa  248  6e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.3 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  31.49 
 
 		 186 aa  61.6  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.8 
 
 		 221 aa  59.3  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  31.33 
 
 		 161 aa  58.9  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.91 
 
 		 171 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  29.71 
 
 		 158 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  29.78 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  23.23 
 
 		 184 aa  53.5  0.000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.13 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  26.58 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.14 
 
 		 172 aa  51.2  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  30.71 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.72 
 
 		 227 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  27.95 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  30.71 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.03 
 
 		 227 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  29.55 
 
 		 534 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  30.82 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.82 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  30.28 
 
 		 176 aa  46.6  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  29.63 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  34.58 
 
 		 163 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  26.01 
 
 		 358 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  27.66 
 
 		 171 aa  45.4  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  30.82 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  28.57 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  28.57 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  29.45 
 
 		 208 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  31.5 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  29.1 
 
 		 211 aa  42.4  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  31.85 
 
 		 209 aa  42  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 226 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>