89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4597 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 208 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  80.75 
 
 		 211 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  81.69 
 
 		 209 aa  268  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  49.69 
 
 		 167 aa  144  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  48.21 
 
 		 192 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  48.12 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  43.87 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  44.81 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  42.66 
 
 		 177 aa  122  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  42.66 
 
 		 177 aa  122  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  41.72 
 
 		 177 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  39.52 
 
 		 534 aa  104  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  39.29 
 
 		 242 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  37.58 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  42.34 
 
 		 212 aa  96.3  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  37.78 
 
 		 358 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  45.38 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  44.62 
 
 		 214 aa  94  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  39.72 
 
 		 172 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  35.88 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  41.18 
 
 		 161 aa  90.1  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  45.32 
 
 		 214 aa  90.1  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  39.72 
 
 		 171 aa  89  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  33.57 
 
 		 241 aa  88.6  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  40.46 
 
 		 243 aa  86.3  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  37.5 
 
 		 211 aa  85.5  6e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  34.29 
 
 		 241 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  37.64 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  35.44 
 
 		 158 aa  80.9  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  34.55 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  37.4 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  34.94 
 
 		 166 aa  79.7  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  37.4 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  27.87 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  35.29 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  38.17 
 
 		 176 aa  73.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  31.85 
 
 		 171 aa  72.8  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 249 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  27.39 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  38 
 
 		 250 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.03 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  27.39 
 
 		 175 aa  70.5  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  37.04 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.85 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  33.54 
 
 		 246 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  33.82 
 
 		 246 aa  64.3  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  37.37 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  34.65 
 
 		 163 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  33.33 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  30.16 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.21 
 
 		 148 aa  57  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  29.55 
 
 		 174 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  31.58 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  33.06 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  31.72 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3714  nuclease (SNase-like)  32.77 
 
 		 156 aa  54.7  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  33.09 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.45 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  31.85 
 
 		 407 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  31.33 
 
 		 186 aa  51.6  0.000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  29.41 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  31.48 
 
 		 329 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.25 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  28.82 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  29.63 
 
 		 319 aa  48.9  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  34.59 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2554  hypothetical protein  31.25 
 
 		 407 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  29.63 
 
 		 319 aa  48.1  0.00008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  27.5 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.9 
 
 		 263 aa  48.1  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  27.91 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  30.51 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  33.59 
 
 		 256 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0619  hypothetical protein  34.41 
 
 		 104 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.810803 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6410  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  30.61 
 
 		 178 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  31.03 
 
 		 233 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  26.62 
 
 		 131 aa  44.7  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 		 169 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9826  hypothetical protein  29.13 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  31.79 
 
 		 249 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  30.19 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  29.45 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  27.27 
 
 		 436 aa  43.1  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  27.27 
 
 		 436 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1584  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 134 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.231891  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.48 
 
 		 240 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  26.83 
 
 		 430 aa  42  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>