30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4029 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  100 
 
 
329 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  80.62 
 
 
319 aa  498  1e-140  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  80.31 
 
 
319 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  43.75 
 
 
281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  43.8 
 
 
236 aa  95.9  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  35.26 
 
 
238 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  35.48 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  34.75 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  32.69 
 
 
242 aa  57.8  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  31.68 
 
 
242 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  30.23 
 
 
177 aa  57  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  31.15 
 
 
177 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  31.15 
 
 
177 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  28.67 
 
 
241 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  31.37 
 
 
189 aa  53.1  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  31.37 
 
 
189 aa  53.1  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  34.86 
 
 
211 aa  52.8  0.000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  33.03 
 
 
209 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  32.33 
 
 
208 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  35.29 
 
 
167 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
243 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  26.61 
 
 
358 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  31.76 
 
 
241 aa  49.3  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  30.69 
 
 
221 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  29.59 
 
 
227 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 
227 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  26.43 
 
 
534 aa  46.6  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  30.61 
 
 
227 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  34.91 
 
 
192 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.65 
 
 
202 aa  43.1  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>