86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4484 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 211 aa  408  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  93.84 
 
 		 209 aa  314  7e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  80.75 
 
 		 208 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  51.55 
 
 		 167 aa  145  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  47.47 
 
 		 192 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  45.33 
 
 		 177 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  44.16 
 
 		 177 aa  123  3e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  44.16 
 
 		 177 aa  123  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  48.51 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  46.45 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  45.45 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  37.21 
 
 		 534 aa  100  2e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  40 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  45.38 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  44.62 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  39.85 
 
 		 212 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  36.36 
 
 		 221 aa  90.1  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  37.4 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  36.43 
 
 		 358 aa  89.4  4e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  42.86 
 
 		 214 aa  89  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  34.29 
 
 		 241 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  40.46 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  32.86 
 
 		 241 aa  81.6  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  39.51 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  36.76 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  36.36 
 
 		 211 aa  78.2  0.00000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  37.68 
 
 		 161 aa  78.2  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  36.36 
 
 		 171 aa  77.4  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  35.76 
 
 		 185 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  34.34 
 
 		 166 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  36.64 
 
 		 220 aa  74.7  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  27.22 
 
 		 184 aa  74.7  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  34.9 
 
 		 158 aa  73.6  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  40.94 
 
 		 163 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  35.88 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  35.88 
 
 		 189 aa  72  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  36.36 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  37.88 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  32.37 
 
 		 171 aa  67  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  37.41 
 
 		 250 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  24.84 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.09 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  25.48 
 
 		 175 aa  62  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  24.84 
 
 		 175 aa  62  0.000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  33.33 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  35 
 
 		 263 aa  61.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  37.11 
 
 		 158 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  33.79 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  28.38 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.3 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  33.58 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  37.31 
 
 		 185 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  34.86 
 
 		 329 aa  53.9  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  33.03 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  37.59 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  32.11 
 
 		 319 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  32.11 
 
 		 319 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  25.15 
 
 		 174 aa  52.8  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4353  hypothetical protein  33.55 
 
 		 199 aa  52.8  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  30.63 
 
 		 168 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  32.31 
 
 		 407 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  32.09 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  32.75 
 
 		 168 aa  49.3  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  28.06 
 
 		 423 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  27.91 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  27.15 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  30.28 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6410  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  31.47 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2554  hypothetical protein  32.54 
 
 		 407 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  29.95 
 
 		 234 aa  45.1  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  37.29 
 
 		 814 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.48 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  29.08 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3714  nuclease (SNase-like)  31.93 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.68 
 
 		 169 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  34.25 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4182  succinoglycan biosynthesis protein exoI-like  32.26 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357437  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9826  hypothetical protein  27.56 
 
 		 179 aa  42.7  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  31.29 
 
 		 229 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  33.07 
 
 		 256 aa  42.4  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  30 
 
 		 436 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  28.96 
 
 		 233 aa  42  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>