18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6410 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6410  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  100 
 
 		 178 aa  366  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9826  hypothetical protein  71.51 
 
 		 179 aa  281  4.0000000000000003e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4567  succinoglycan biosynthesis protein ExoI-like protein  68.16 
 
 		 179 aa  258  3e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.019847  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4182  succinoglycan biosynthesis protein exoI-like  63.64 
 
 		 178 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.357437  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4450  succinoglycan biosynthesis protein exoI-like  42.26 
 
 		 199 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.623703  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6223  hypothetical protein  46.9 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.543839 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.17 
 
 		 534 aa  54.3  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6224  hypothetical protein  31.16 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.308252 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  33.58 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  33.58 
 
 		 177 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 		 177 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  30.61 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  28.75 
 
 		 227 aa  44.3  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  29.03 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  28.75 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  31.16 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  27.27 
 
 		 227 aa  41.6  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  28.12 
 
 		 168 aa  41.6  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>