75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1886 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  100 
 
 		 192 aa  360  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  47.12 
 
 		 208 aa  145  3e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  46.97 
 
 		 209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  47.5 
 
 		 211 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  44.59 
 
 		 167 aa  118  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  38.37 
 
 		 177 aa  104  6e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  39.86 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  39.86 
 
 		 177 aa  104  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  45.14 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  43.21 
 
 		 227 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  42.86 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  35.81 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  39.29 
 
 		 212 aa  86.7  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  38.41 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  41.86 
 
 		 226 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  41.09 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  39.42 
 
 		 534 aa  74.3  0.0000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38.93 
 
 		 214 aa  70.5  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  31.94 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  36.18 
 
 		 171 aa  68.6  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  34.48 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  34.48 
 
 		 189 aa  68.2  0.00000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  35.62 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  28.78 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  37.91 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.04 
 
 		 161 aa  62.4  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  32.33 
 
 		 358 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  30.94 
 
 		 242 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.56 
 
 		 172 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  33.77 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  30.94 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  31.85 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.03 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.09 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  38.98 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  26.62 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.35 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  33.33 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5115  glycosyl transferase family 51  30 
 
 		 660 aa  52  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  35.07 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3611  1A family penicillin-binding protein  32.77 
 
 		 814 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.246117  hitchhiker  0.00429634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  34.07 
 
 		 246 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  31.52 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  38.06 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  35.96 
 
 		 238 aa  48.1  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  37.08 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  34.33 
 
 		 263 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  21.57 
 
 		 175 aa  47.8  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3022  glycosyl transferase family protein  31.62 
 
 		 681 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  22.22 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  30.43 
 
 		 423 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  21.57 
 
 		 175 aa  47  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  34.02 
 
 		 319 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  34.02 
 
 		 319 aa  45.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1670  hypothetical protein  28 
 
 		 430 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.299768  normal  0.863632 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  31.78 
 
 		 158 aa  45.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  31.62 
 
 		 166 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  28.83 
 
 		 168 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  34.02 
 
 		 329 aa  45.1  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1848  hypothetical protein  28.81 
 
 		 436 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  0.515923 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1569  hypothetical protein  28.81 
 
 		 436 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.39928  normal  0.0673531 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4939  hypothetical protein  29.17 
 
 		 407 aa  44.7  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0706  1A family penicillin-binding protein  31.67 
 
 		 830 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.679519  normal  0.247814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0719  penicillin-binding protein, 1A family  30.83 
 
 		 830 aa  42.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.347949  normal  0.695169 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  31.54 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  29.29 
 
 		 158 aa  42  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  30 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0677  penicillin-binding protein, 1A family  31.2 
 
 		 815 aa  41.6  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.187464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  34.48 
 
 		 281 aa  41.2  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2554  hypothetical protein  28.45 
 
 		 407 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.315018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>