29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1653 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  355  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  34.03 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.69 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  30.16 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.33 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  29.85 
 
 		 167 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  27.4 
 
 		 221 aa  51.6  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  31.75 
 
 		 211 aa  51.2  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  31.3 
 
 		 212 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  29.85 
 
 		 227 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.21 
 
 		 534 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  27.08 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  24.48 
 
 		 220 aa  48.9  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  31.25 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  23.84 
 
 		 241 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  27.94 
 
 		 227 aa  47.4  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  27.48 
 
 		 242 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  27.94 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  31.75 
 
 		 209 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  27.34 
 
 		 214 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  28.38 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  28.32 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  31.87 
 
 		 231 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  28.32 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  28.35 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  29.69 
 
 		 358 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  26.92 
 
 		 242 aa  41.6  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  22.08 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  22.08 
 
 		 177 aa  41.2  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>