47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4183 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  60.47 
 
 		 229 aa  248  6e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  55.16 
 
 		 233 aa  236  2e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  51.3 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  34.9 
 
 		 161 aa  71.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  31.87 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  31.13 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  28.96 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  33.78 
 
 		 227 aa  62  0.000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  30.99 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  33.8 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 227 aa  58.2  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.11 
 
 		 168 aa  57.8  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30.5 
 
 		 184 aa  58.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  30.26 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.72 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  35.21 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  30.2 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  32.47 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  28.38 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.31 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.64 
 
 		 171 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.54 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  31.54 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  28.86 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  30.28 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  30.43 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  31.78 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  26.2 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  30.28 
 
 		 172 aa  50.1  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  29.75 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  26.53 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  26.53 
 
 		 189 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  28.36 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  31.62 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  25.56 
 
 		 174 aa  46.6  0.0004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6222  nuclease (SNase domain protein)  28.06 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.515263 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  31.13 
 
 		 534 aa  45.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.93 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  28.87 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  28.86 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  25 
 
 		 199 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  31.87 
 
 		 170 aa  43.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  27.54 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  27.54 
 
 		 177 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4113  hypothetical protein  29.32 
 
 		 423 aa  42  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.226985 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>