124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4628 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  100 
 
 		 242 aa  492  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  89.26 
 
 		 242 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  71.07 
 
 		 241 aa  370  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  79.65 
 
 		 243 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  71.82 
 
 		 241 aa  344  8e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  51.82 
 
 		 358 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  40.69 
 
 		 227 aa  158  7e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  40.69 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  39.29 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  35.06 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  35.43 
 
 		 249 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.64 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  37.06 
 
 		 211 aa  111  9e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  38.96 
 
 		 212 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  33.73 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.18 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  32.27 
 
 		 263 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  36.53 
 
 		 246 aa  108  6e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  41.25 
 
 		 202 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  42.22 
 
 		 161 aa  105  8e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  34.3 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  39.29 
 
 		 208 aa  103  3e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  37.42 
 
 		 171 aa  102  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  41.1 
 
 		 167 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  35.03 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  35.03 
 
 		 177 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  34.48 
 
 		 177 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  35.97 
 
 		 172 aa  97.4  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  39.13 
 
 		 534 aa  96.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  37.93 
 
 		 189 aa  95.9  5e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.49 
 
 		 226 aa  95.9  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  37.93 
 
 		 189 aa  95.9  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  35.62 
 
 		 158 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  40 
 
 		 209 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.92 
 
 		 221 aa  92  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  34.3 
 
 		 195 aa  91.3  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  34.16 
 
 		 166 aa  89.7  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  30.57 
 
 		 220 aa  87.4  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  31.43 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  36.84 
 
 		 176 aa  79.7  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  38.56 
 
 		 175 aa  79.3  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  32.09 
 
 		 171 aa  75.5  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  39.84 
 
 		 163 aa  74.7  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.93 
 
 		 168 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.17 
 
 		 148 aa  71.6  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  37.59 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  26.12 
 
 		 388 aa  67  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  41.94 
 
 		 185 aa  65.9  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  25.77 
 
 		 175 aa  65.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  26.38 
 
 		 175 aa  65.5  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  25.77 
 
 		 175 aa  64.7  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  35.83 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.46 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  30.28 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30 
 
 		 174 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.6 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  32.28 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0217  hypothetical protein  31.03 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.530241  normal  0.176582 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  29.86 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  28.9 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4183  nuclease (SNase-like)  28.67 
 
 		 231 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.283514  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  32.69 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.1 
 
 		 187 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  30.86 
 
 		 175 aa  57  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.06 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  33.96 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  30.25 
 
 		 170 aa  55.5  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0394  hypothetical protein  51.92 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9827  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  31.97 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  31.73 
 
 		 319 aa  54.7  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1898  hypothetical protein  56.6 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0131013  normal  0.0107915 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 169 aa  54.7  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  32.43 
 
 		 150 aa  54.3  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  26.58 
 
 		 155 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.29 
 
 		 169 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.67 
 
 		 158 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.82 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.46 
 
 		 162 aa  53.5  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  30.77 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 319 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.93 
 
 		 153 aa  52.4  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  33.83 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  35.09 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  31.65 
 
 		 169 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  31.96 
 
 		 158 aa  51.6  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.1 
 
 		 153 aa  51.6  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0188  hypothetical protein  27.47 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  25.68 
 
 		 170 aa  50.8  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  32.52 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  36.17 
 
 		 171 aa  50.1  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  24.07 
 
 		 153 aa  50.4  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6411  nuclease  33.59 
 
 		 233 aa  50.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  28.7 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  33.1 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4568  nuclease  30.71 
 
 		 229 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.313094  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  27.78 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  31.47 
 
 		 182 aa  49.7  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  32.77 
 
 		 175 aa  48.9  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>