142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5373 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  100 
 
 		 176 aa  353  5e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  52.9 
 
 		 172 aa  161  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  52.76 
 
 		 171 aa  161  6e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  46.41 
 
 		 158 aa  136  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  49.33 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  46.45 
 
 		 227 aa  122  3e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  45.16 
 
 		 227 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  46.43 
 
 		 212 aa  117  6e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  44 
 
 		 227 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  44.85 
 
 		 534 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  42.58 
 
 		 221 aa  107  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  41.4 
 
 		 161 aa  107  8.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  39.22 
 
 		 211 aa  106  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  40.79 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  46.56 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  46.56 
 
 		 189 aa  101  6e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  39.46 
 
 		 167 aa  98.2  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  41.18 
 
 		 220 aa  97.4  8e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  42.14 
 
 		 214 aa  94.7  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  41.54 
 
 		 214 aa  91.3  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  42.31 
 
 		 226 aa  90.5  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  38.41 
 
 		 242 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  39.04 
 
 		 241 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  42.03 
 
 		 243 aa  85.9  3e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  37.59 
 
 		 241 aa  85.1  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  38.85 
 
 		 195 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  29.68 
 
 		 184 aa  82  0.000000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  36.96 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  42.38 
 
 		 163 aa  80.9  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  33.57 
 
 		 358 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  38.73 
 
 		 208 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  39.37 
 
 		 158 aa  74.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  31.82 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.53 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  31.82 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  28.48 
 
 		 175 aa  71.6  0.000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  43.22 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  35.14 
 
 		 185 aa  71.2  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.58 
 
 		 174 aa  70.9  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  30.38 
 
 		 177 aa  70.9  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 		 249 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  32.68 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  32.92 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.74 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  31.58 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  31.58 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  36.23 
 
 		 211 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32.9 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  36.23 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  35.71 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  32.68 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  31.76 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  35.67 
 
 		 246 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  33.33 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  37.78 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  31.65 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  37.34 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.32 
 
 		 148 aa  59.7  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.08 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.1 
 
 		 171 aa  58.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  28.39 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.57 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  28.4 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.82 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  35.67 
 
 		 250 aa  57.8  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  32.19 
 
 		 157 aa  57  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.4 
 
 		 169 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.6 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  30.77 
 
 		 170 aa  57.4  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  26.75 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.33 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  36.09 
 
 		 238 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  31.97 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.58 
 
 		 155 aa  53.9  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 		 158 aa  53.9  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  29.46 
 
 		 164 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  31.29 
 
 		 170 aa  52.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.52 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  29.44 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  31.82 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  36.89 
 
 		 185 aa  52  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.88 
 
 		 180 aa  51.6  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.15 
 
 		 240 aa  51.6  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  29.75 
 
 		 216 aa  51.6  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.59 
 
 		 178 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 161 aa  50.8  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.06 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  29.88 
 
 		 157 aa  50.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  34.38 
 
 		 246 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  31.47 
 
 		 155 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  34.72 
 
 		 273 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  26.4 
 
 		 153 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3714  nuclease (SNase-like)  30.65 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  33.08 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 169 aa  48.9  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  35.2 
 
 		 224 aa  48.1  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  32.43 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  36.75 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  34.29 
 
 		 273 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>