98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2078 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 185 aa  367  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  84.32 
 
 		 185 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  44.51 
 
 		 202 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  42.45 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  42.45 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  32.3 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  35.59 
 
 		 221 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  46.34 
 
 		 163 aa  101  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  40.67 
 
 		 171 aa  98.2  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  38.61 
 
 		 195 aa  91.7  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  41.86 
 
 		 214 aa  88.6  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  42.64 
 
 		 226 aa  87.8  7e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  42.28 
 
 		 214 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  34.87 
 
 		 220 aa  85.1  5e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  38.51 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  40.6 
 
 		 242 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  37.69 
 
 		 534 aa  80.5  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  40.56 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  37.5 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  38.57 
 
 		 241 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  41.13 
 
 		 227 aa  78.2  0.00000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  39.01 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  38.24 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  74.3  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  45.67 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  37.04 
 
 		 167 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  36.51 
 
 		 166 aa  73.2  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  33.54 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  34.04 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  35.38 
 
 		 157 aa  65.1  0.0000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  34.35 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.65 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  37.76 
 
 		 243 aa  61.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  32.52 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  33.55 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  35.85 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  32.81 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  36.89 
 
 		 176 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.82 
 
 		 172 aa  58.5  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  34.96 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  34.96 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.41 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.77 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  40 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  32.35 
 
 		 177 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.32 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  34.23 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  26.62 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  30.6 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  37.04 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.3 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  32.32 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  32.28 
 
 		 250 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  28.37 
 
 		 153 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  27.66 
 
 		 153 aa  52.4  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  36.92 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  39.34 
 
 		 153 aa  52  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.23 
 
 		 187 aa  52  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  32.65 
 
 		 182 aa  52  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  25.58 
 
 		 175 aa  51.6  0.000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  33.62 
 
 		 175 aa  51.6  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  25.58 
 
 		 175 aa  51.2  0.000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  25.58 
 
 		 175 aa  51.2  0.000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  37.39 
 
 		 136 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 		 228 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  37.01 
 
 		 171 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.91 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  27.27 
 
 		 153 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  31.3 
 
 		 282 aa  49.3  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.64 
 
 		 238 aa  48.9  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  30.32 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  30.95 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  30.16 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.56 
 
 		 246 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  29.11 
 
 		 171 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  29.94 
 
 		 263 aa  46.6  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  33.06 
 
 		 161 aa  46.2  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35.43 
 
 		 162 aa  45.8  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  27.2 
 
 		 247 aa  45.8  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  32.21 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  31.91 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  30.92 
 
 		 185 aa  45.1  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  33.07 
 
 		 246 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4452  hypothetical protein  33.04 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.11 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  30.17 
 
 		 158 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  30.66 
 
 		 272 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  30.16 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  31.5 
 
 		 240 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.25 
 
 		 166 aa  42.7  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  28.12 
 
 		 169 aa  42.4  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  36.5 
 
 		 208 aa  42  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  29.45 
 
 		 205 aa  42  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0138  hypothetical protein  28.03 
 
 		 281 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  23.38 
 
 		 156 aa  41.6  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  29.45 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.28 
 
 		 166 aa  40.8  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>