114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4153 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  100 
 
 		 166 aa  338  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  53.55 
 
 		 534 aa  174  4e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  50.69 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  49.68 
 
 		 171 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  60.78 
 
 		 158 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  48.05 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  46.75 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  48 
 
 		 227 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  44.87 
 
 		 158 aa  121  4e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  49.63 
 
 		 176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  47.71 
 
 		 161 aa  115  3e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  44.68 
 
 		 212 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  40.38 
 
 		 211 aa  110  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  40.97 
 
 		 214 aa  93.6  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  37.04 
 
 		 220 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 358 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  39.07 
 
 		 167 aa  89.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  38.69 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  38.69 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  42.42 
 
 		 214 aa  85.1  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  34.87 
 
 		 221 aa  84.7  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  36.13 
 
 		 241 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  37.23 
 
 		 242 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  41.67 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  38.1 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  40.3 
 
 		 243 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  35.97 
 
 		 242 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  32.17 
 
 		 184 aa  79.3  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  37.41 
 
 		 208 aa  79  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  34.67 
 
 		 226 aa  79  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  38.24 
 
 		 241 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  33.55 
 
 		 171 aa  76.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  39.62 
 
 		 163 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.14 
 
 		 168 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  30.97 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  30.97 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  32.03 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  35.86 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  36.05 
 
 		 195 aa  67.8  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  37.88 
 
 		 209 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  37.12 
 
 		 211 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  36.51 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  37.29 
 
 		 136 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  34.84 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.68 
 
 		 183 aa  60.8  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  29.68 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  33.78 
 
 		 158 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  37.96 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  31.61 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  30.72 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  35.38 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  31.3 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.72 
 
 		 153 aa  57  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  33.59 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  28.48 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  29.61 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.67 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  32.64 
 
 		 263 aa  55.1  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  31.62 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  30.57 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  32.21 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  29.7 
 
 		 148 aa  53.9  0.0000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  27.04 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.11 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  34.65 
 
 		 240 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.24 
 
 		 175 aa  52.4  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  31.85 
 
 		 244 aa  52.4  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.25 
 
 		 199 aa  51.6  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  28.65 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.65 
 
 		 175 aa  51.6  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  28.57 
 
 		 232 aa  51.2  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  25.7 
 
 		 227 aa  50.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3714  nuclease (SNase-like)  33.83 
 
 		 156 aa  50.8  0.000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  35.92 
 
 		 278 aa  50.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  33.87 
 
 		 284 aa  50.8  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  31.58 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  35.46 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  32.5 
 
 		 250 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  39.36 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  31.65 
 
 		 131 aa  50.1  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  27.78 
 
 		 185 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  30.26 
 
 		 222 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  27.86 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.59 
 
 		 169 aa  48.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.81 
 
 		 166 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  35.66 
 
 		 175 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  32.99 
 
 		 272 aa  48.1  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  31.82 
 
 		 388 aa  47.4  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  33.77 
 
 		 350 aa  47  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  27.21 
 
 		 171 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  27.01 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  25.6 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  27.4 
 
 		 163 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  35.04 
 
 		 170 aa  45.1  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  32.79 
 
 		 161 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  34.15 
 
 		 216 aa  44.7  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.28 
 
 		 192 aa  44.7  0.0006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  31.85 
 
 		 187 aa  44.3  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>