38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3714 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3714  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 156 aa  320  5e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.551485 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  43.07 
 
 		 131 aa  104  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  37.93 
 
 		 169 aa  82.8  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.01 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  33.33 
 
 		 534 aa  57.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  39.34 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  31.67 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0619  hypothetical protein  37.61 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.810803 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32.17 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.75 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  31.9 
 
 		 208 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  37.04 
 
 		 214 aa  50.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.46 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  31.67 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  30.16 
 
 		 172 aa  48.5  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  33.33 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  30.34 
 
 		 148 aa  47.8  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.71 
 
 		 199 aa  47.4  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  31.48 
 
 		 227 aa  47.4  0.00008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  32.35 
 
 		 158 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  30.28 
 
 		 227 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  26.67 
 
 		 220 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  34.69 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 192 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  32.38 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  30.28 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  31.82 
 
 		 174 aa  45.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  33.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  33.72 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  34.09 
 
 		 175 aa  45.1  0.0004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.67 
 
 		 226 aa  44.7  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  35 
 
 		 209 aa  44.3  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  29.91 
 
 		 168 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  29.09 
 
 		 176 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  25.81 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  32.26 
 
 		 158 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.3 
 
 		 211 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>