230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0563 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  100 
 
 		 174 aa  349  1e-95  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  48.26 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  48.26 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  47.67 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  41.58 
 
 		 199 aa  128  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  41.72 
 
 		 148 aa  121  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  42.48 
 
 		 153 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  40.38 
 
 		 244 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  43.61 
 
 		 153 aa  119  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  41.03 
 
 		 153 aa  115  3e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  38.52 
 
 		 238 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  34.81 
 
 		 232 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  42.86 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  38.62 
 
 		 161 aa  110  9e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  35.62 
 
 		 206 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  35.14 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  35.06 
 
 		 179 aa  106  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  38.93 
 
 		 185 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  36.25 
 
 		 164 aa  106  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  41.73 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  36.54 
 
 		 153 aa  105  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  37.24 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  39.55 
 
 		 182 aa  103  2e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  37.25 
 
 		 157 aa  101  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  36.49 
 
 		 180 aa  101  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  36.92 
 
 		 153 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  33.9 
 
 		 185 aa  98.2  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  32.52 
 
 		 171 aa  97.8  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.93 
 
 		 187 aa  95.5  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.17 
 
 		 171 aa  95.1  4e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.72 
 
 		 169 aa  94.4  8e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  32.92 
 
 		 221 aa  94  9e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  31.71 
 
 		 175 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  30.86 
 
 		 183 aa  92  4e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  31.87 
 
 		 221 aa  91.7  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  36.03 
 
 		 227 aa  89.4  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  37.11 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  33.33 
 
 		 225 aa  87.8  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  33.58 
 
 		 196 aa  87.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.37 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.37 
 
 		 205 aa  87  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  31.14 
 
 		 194 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  35.66 
 
 		 187 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.13 
 
 		 214 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.17 
 
 		 169 aa  85.5  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  37.98 
 
 		 216 aa  85.1  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 183 aa  85.1  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.61 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  31.68 
 
 		 175 aa  84.7  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  37.31 
 
 		 171 aa  84.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  30.91 
 
 		 175 aa  84.3  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  31.52 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  32.88 
 
 		 166 aa  84  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  33.97 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  31.71 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  37.82 
 
 		 214 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  29.8 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  30.37 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.97 
 
 		 226 aa  81.3  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  31.29 
 
 		 193 aa  80.9  0.000000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  31.88 
 
 		 162 aa  80.1  0.00000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.42 
 
 		 161 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  28.49 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  38.81 
 
 		 351 aa  78.2  0.00000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  34.09 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  31.85 
 
 		 185 aa  77.8  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  35.07 
 
 		 227 aa  77.4  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  35.51 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  34.4 
 
 		 169 aa  76.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  28.66 
 
 		 167 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  38.4 
 
 		 178 aa  74.7  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  31.29 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  34.85 
 
 		 178 aa  75.1  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  32.17 
 
 		 233 aa  75.1  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  37.23 
 
 		 534 aa  74.7  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  32.58 
 
 		 150 aa  73.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  36.36 
 
 		 167 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  27.85 
 
 		 227 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  33.99 
 
 		 327 aa  72.4  0.000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  27.42 
 
 		 193 aa  72  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  30.92 
 
 		 301 aa  72  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  29.89 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  33.61 
 
 		 212 aa  71.2  0.000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.86 
 
 		 258 aa  71.2  0.000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  30.86 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.09 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  31.95 
 
 		 221 aa  70.9  0.000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  31.97 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  33.58 
 
 		 176 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  34.21 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.48 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  33.1 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  34.38 
 
 		 266 aa  68.9  0.00000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.86 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  33.1 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  29.11 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  28.92 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.16 
 
 		 183 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  30.83 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  32.43 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>