140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0143 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  100 
 
 		 193 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  40.12 
 
 		 232 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  40.67 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.21 
 
 		 179 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  35.96 
 
 		 187 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  40.41 
 
 		 158 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  36.87 
 
 		 183 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  37.95 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  31.69 
 
 		 180 aa  102  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  41.67 
 
 		 150 aa  101  6e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.06 
 
 		 171 aa  101  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  33.14 
 
 		 175 aa  100  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  37.36 
 
 		 171 aa  100  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.56 
 
 		 175 aa  100  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.56 
 
 		 175 aa  99.4  3e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  39.13 
 
 		 153 aa  99  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  36.53 
 
 		 169 aa  99.4  3e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  37.41 
 
 		 148 aa  97.1  1e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  38.96 
 
 		 164 aa  97.4  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  34.3 
 
 		 244 aa  97.1  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  39.86 
 
 		 156 aa  95.9  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  36.61 
 
 		 175 aa  94.7  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  35.98 
 
 		 185 aa  94.4  9e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  38.46 
 
 		 194 aa  94.4  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  34.59 
 
 		 225 aa  93.2  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  38.1 
 
 		 227 aa  92  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  38.04 
 
 		 185 aa  90.5  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.99 
 
 		 153 aa  90.5  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  34.24 
 
 		 182 aa  89.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  38.78 
 
 		 187 aa  89  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  37.66 
 
 		 169 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.06 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  43.48 
 
 		 212 aa  88.2  8e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  34.86 
 
 		 221 aa  88.2  8e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.95 
 
 		 174 aa  87.8  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.93 
 
 		 157 aa  87.4  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  38.29 
 
 		 171 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  31.1 
 
 		 167 aa  86.3  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  36.17 
 
 		 161 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.68 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.95 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.32 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  32.98 
 
 		 183 aa  82.4  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  30.6 
 
 		 228 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  28.74 
 
 		 192 aa  82  0.000000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  30.11 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  31.1 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  32.48 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  33.13 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  38.46 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  36.62 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  32.74 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  33.33 
 
 		 227 aa  76.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.17 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1985  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.242918  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  31.29 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  38.1 
 
 		 208 aa  72.4  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.82 
 
 		 162 aa  72  0.000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  31.25 
 
 		 193 aa  71.2  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  32.2 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  29.94 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  34.94 
 
 		 161 aa  68.6  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.56 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  29.7 
 
 		 226 aa  66.2  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  32.43 
 
 		 221 aa  65.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  31.61 
 
 		 171 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  27.63 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.52 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  29.88 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.13 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  32.5 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  29.12 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  30.26 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  31.82 
 
 		 168 aa  58.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  31.11 
 
 		 235 aa  57.4  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.39353 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9251  predicted protein  29.41 
 
 		 164 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  34.48 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  34.48 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  29.38 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  25.88 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45339  predicted protein  30.77 
 
 		 334 aa  54.7  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  35.56 
 
 		 240 aa  54.7  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  25.57 
 
 		 155 aa  54.7  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  27.91 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  33.33 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.4 
 
 		 171 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  30.99 
 
 		 157 aa  52.8  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.33 
 
 		 155 aa  52.8  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  31.43 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 226 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  31.43 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  35.45 
 
 		 350 aa  52  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00258  staphylococcal nuclease domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03430)  28.67 
 
 		 280 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0130052 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3707  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.112464  normal  0.156975 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3653  nuclease (SNase domain protein)  28.57 
 
 		 171 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  31.07 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  26.28 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  33.09 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  32.1 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  32.89 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>