170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1969 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 172 aa  343  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  83.14 
 
 		 171 aa  288  2e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  75.32 
 
 		 158 aa  241  5e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  52.98 
 
 		 176 aa  157  8e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  47.53 
 
 		 166 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  45.16 
 
 		 227 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  45.16 
 
 		 227 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  47.02 
 
 		 227 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  47.17 
 
 		 161 aa  130  6.999999999999999e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  46.36 
 
 		 534 aa  129  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  41.57 
 
 		 211 aa  118  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  45.39 
 
 		 214 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  47.14 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  49.23 
 
 		 226 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  48.46 
 
 		 214 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  39.39 
 
 		 358 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  40.13 
 
 		 167 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  39.49 
 
 		 202 aa  104  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  46.46 
 
 		 158 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  38.04 
 
 		 221 aa  99.8  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  36.23 
 
 		 242 aa  99  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  36.23 
 
 		 242 aa  98.2  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  38.41 
 
 		 243 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  34.64 
 
 		 241 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  37.88 
 
 		 241 aa  93.2  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  39.72 
 
 		 208 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  33.54 
 
 		 171 aa  92  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  35.86 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  35.86 
 
 		 189 aa  90.9  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  32.08 
 
 		 184 aa  90.1  1e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  33.95 
 
 		 220 aa  89  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  36.24 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  36.24 
 
 		 177 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  38.85 
 
 		 195 aa  88.6  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  35.63 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  40.88 
 
 		 163 aa  82  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  36.15 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  36.72 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  33.82 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  33.12 
 
 		 148 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  32.21 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  33.11 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  37.34 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  33.77 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  37.5 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  31.01 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0480  nuclease  41.88 
 
 		 136 aa  74.3  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.898976  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.26 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  32.56 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.92 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.52 
 
 		 226 aa  72  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  31.37 
 
 		 156 aa  72  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  30.26 
 
 		 175 aa  72  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.65 
 
 		 164 aa  70.9  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  32.58 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3789  SNase-like nuclease  31.11 
 
 		 131 aa  70.5  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0300901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  39.33 
 
 		 240 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  36.3 
 
 		 186 aa  68.9  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  28.47 
 
 		 174 aa  67.8  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1131  nuclease (SNase-like)  32.81 
 
 		 246 aa  67.4  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.844533  normal  0.680053 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  27.98 
 
 		 199 aa  67  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0791  nuclease (SNase-like)  38.18 
 
 		 169 aa  66.6  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.71 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.91 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  29.22 
 
 		 153 aa  63.9  0.0000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  29.87 
 
 		 153 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  32.43 
 
 		 171 aa  62.8  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 		 238 aa  62  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  32.87 
 
 		 175 aa  62  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  29.66 
 
 		 179 aa  62  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  33.85 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  34.87 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  34.81 
 
 		 157 aa  60.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  28.66 
 
 		 175 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  37.12 
 
 		 224 aa  60.1  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  33.1 
 
 		 178 aa  59.7  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  44.09 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1653  hypothetical protein  31.03 
 
 		 170 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164251  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  38.52 
 
 		 192 aa  59.3  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  32.9 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  31.87 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  32.14 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  31.18 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  28.57 
 
 		 244 aa  58.2  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.43 
 
 		 263 aa  57.8  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  32.67 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.56 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  35.48 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.18 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  30.72 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  32.2 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  31.62 
 
 		 333 aa  55.1  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  28.91 
 
 		 166 aa  55.1  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.14 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  37.29 
 
 		 170 aa  54.7  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  29.32 
 
 		 153 aa  53.9  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  32.82 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  33.33 
 
 		 182 aa  53.1  0.000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  25.86 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>