200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0576 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  100 
 
 
212 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  76.42 
 
 
211 aa  315  3e-85  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  48.85 
 
 
227 aa  157  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  48.55 
 
 
227 aa  155  6e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  41.82 
 
 
220 aa  153  2e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  48.77 
 
 
227 aa  148  5e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  50 
 
 
534 aa  135  5e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  46.05 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  45.75 
 
 
161 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  42.21 
 
 
167 aa  125  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  47.37 
 
 
158 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4153  nuclease (SNase domain protein)  42.21 
 
 
166 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574783  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  47.76 
 
 
176 aa  115  5e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  47.14 
 
 
172 aa  115  6e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  39.31 
 
 
241 aa  112  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  38.78 
 
 
242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  36.05 
 
 
242 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  38.78 
 
 
243 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3323  nuclease  45.1 
 
 
163 aa  102  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.763522 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  37.75 
 
 
221 aa  102  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  32.92 
 
 
226 aa  102  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  46.56 
 
 
226 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  37.33 
 
 
358 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  45.45 
 
 
214 aa  101  8e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  42.66 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  32.5 
 
 
184 aa  98.6  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1730  nuclease  42.28 
 
 
175 aa  98.2  8e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0510494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4597  nuclease (SNase domain protein)  42.34 
 
 
208 aa  97.4  1e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0232149  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2156  nuclease (SNase domain protein)  39.86 
 
 
177 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641386  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2193  nuclease  39.55 
 
 
177 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2471  nuclease (SNase domain protein)  39.55 
 
 
177 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  36.73 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  38.61 
 
 
202 aa  95.1  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  35.29 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  35.29 
 
 
189 aa  94.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  40.85 
 
 
179 aa  94.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  38.06 
 
 
185 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  39.58 
 
 
158 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2100  nuclease (SNase-like)  41.96 
 
 
192 aa  90.5  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  43.48 
 
 
193 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6085  nuclease  48.48 
 
 
158 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1886  nuclease  38.97 
 
 
192 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0247855 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.74 
 
 
180 aa  84  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4484  nuclease (SNase domain protein)  39.23 
 
 
211 aa  83.6  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.270396  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.25 
 
 
183 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4116  nuclease  39.06 
 
 
209 aa  82.8  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.373469  normal  0.63366 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.33 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  35.57 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  35.62 
 
 
168 aa  82  0.000000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 
153 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0424  nuclease (SNase-like)  33.77 
 
 
250 aa  81.3  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.445506  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.32 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.32 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5043  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 
249 aa  78.2  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  36.3 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 
171 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  30.3 
 
 
175 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  29.7 
 
 
175 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.09 
 
 
148 aa  77.8  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  33.13 
 
 
156 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  32.47 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  30.82 
 
 
175 aa  75.9  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.34 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  29.7 
 
 
232 aa  74.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  32.76 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  27.75 
 
 
233 aa  72  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.61 
 
 
174 aa  71.6  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2154  excalibur domain family  58.33 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2180  hypothetical protein  59.57 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  28.38 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2215  hypothetical protein  59.57 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1973  hypothetical protein  59.57 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000663025  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  64.29 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2296  hypothetical protein  59.57 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396677  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0742  putative lipoprotein  34.68 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0791  hypothetical protein  34.68 
 
 
319 aa  69.7  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2000  hypothetical protein  59.57 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2149  hypothetical protein  59.57 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4029  hypothetical protein  35.48 
 
 
329 aa  69.3  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0059  LGFP repeat protein  84.21 
 
 
351 aa  69.3  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.183151  normal  0.560607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.78 
 
 
244 aa  68.2  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.96 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  31 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2752  hypothetical protein  30.06 
 
 
263 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2078  nuclease (SNase domain protein)  34 
 
 
185 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0136  Excalibur domain protein  65.31 
 
 
382 aa  67.4  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.23 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1032  SNase-like nuclease  32.14 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1992  Excalibur domain-containing protein  51.85 
 
 
334 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00268093  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  31.86 
 
 
231 aa  65.1  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2052  succinoglycan biosynthesis protein  33.33 
 
 
171 aa  65.1  0.0000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132309  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  29.82 
 
 
175 aa  65.1  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  34.81 
 
 
153 aa  64.7  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  33.74 
 
 
157 aa  64.7  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3160  hypothetical protein  55.32 
 
 
330 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0554413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.21 
 
 
175 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  28.48 
 
 
199 aa  63.2  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5258  nuclease  33.74 
 
 
170 aa  62  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.486577  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.33 
 
 
169 aa  62  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  36.76 
 
 
153 aa  61.6  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>