209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_B0084 on replicon NC_011350
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  100 
 
 		 153 aa  316  9e-86  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  95.42 
 
 		 153 aa  301  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  55.56 
 
 		 164 aa  188  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  58.82 
 
 		 156 aa  187  5.999999999999999e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  45.86 
 
 		 238 aa  121  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  40.67 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  45.8 
 
 		 153 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  41.03 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  40.4 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  41.38 
 
 		 153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  37.09 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  36.42 
 
 		 175 aa  112  2.0000000000000002e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  36.42 
 
 		 175 aa  111  3e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  38.93 
 
 		 225 aa  111  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 		 169 aa  110  5e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  45.11 
 
 		 196 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  42.86 
 
 		 227 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  37.5 
 
 		 175 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  42.86 
 
 		 244 aa  108  3e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  44.12 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  40.54 
 
 		 148 aa  107  7.000000000000001e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  38.61 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  41.35 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  34.57 
 
 		 206 aa  103  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  42.22 
 
 		 182 aa  103  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  39.06 
 
 		 192 aa  102  1e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  38.1 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  42.52 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  41.91 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  34.84 
 
 		 221 aa  100  9e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  38.69 
 
 		 171 aa  99.8  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  38.89 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  35.38 
 
 		 184 aa  98.6  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  36.31 
 
 		 221 aa  97.4  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  40.31 
 
 		 185 aa  95.9  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  41.79 
 
 		 169 aa  94.7  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  35.33 
 
 		 166 aa  92.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.31 
 
 		 179 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  34.44 
 
 		 162 aa  88.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  36.92 
 
 		 138 aa  88.6  3e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  40.43 
 
 		 187 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  31.33 
 
 		 167 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.67 
 
 		 191 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  40.6 
 
 		 208 aa  86.7  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  34.55 
 
 		 180 aa  85.5  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  36.91 
 
 		 205 aa  85.9  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  36.24 
 
 		 183 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  36.88 
 
 		 194 aa  84.3  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.67 
 
 		 171 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  36.96 
 
 		 175 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  36.05 
 
 		 193 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  38.13 
 
 		 185 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  32.33 
 
 		 157 aa  80.1  0.000000000000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  36.15 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.82 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  38.21 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.12 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  41.67 
 
 		 161 aa  77  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  40.15 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.01 
 
 		 183 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  29.93 
 
 		 233 aa  74.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  36.96 
 
 		 227 aa  72  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  32.31 
 
 		 163 aa  72.4  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.94 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  37.5 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  36.76 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  34.51 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  32.4 
 
 		 205 aa  68.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  31.3 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  31.3 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2776  nuclease (SNase-like)  31.18 
 
 		 186 aa  67.4  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  33.56 
 
 		 158 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  31.13 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  35.71 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  32.48 
 
 		 161 aa  65.5  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  30 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  36.57 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  40 
 
 		 175 aa  64.7  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.1 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  30.3 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  32.33 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9903  succinoglycan biosynthesis protein  32.26 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  33.87 
 
 		 388 aa  62.8  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  34.04 
 
 		 168 aa  62.8  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  29.59 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  34.01 
 
 		 534 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  38.95 
 
 		 155 aa  62  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  32.73 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3848  nuclease  34.27 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  30.61 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  34.39 
 
 		 272 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1467  Excalibur domain-containing protein  35.19 
 
 		 259 aa  60.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  31.82 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  33.86 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.77 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.77 
 
 		 228 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  34.88 
 
 		 258 aa  60.5  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>