139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0873 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 178 aa  356  9e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  46.43 
 
 		 175 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  46.39 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  36.3 
 
 		 175 aa  86.7  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  36.3 
 
 		 175 aa  86.3  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  37.04 
 
 		 175 aa  86.7  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  36.42 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  35.53 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  34.85 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.02 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  32.58 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  35.88 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  34.81 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  37.88 
 
 		 164 aa  69.7  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  32.91 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  37.3 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.61 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  33.9 
 
 		 187 aa  67.4  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  35.71 
 
 		 153 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  34.92 
 
 		 153 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  32.09 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.38 
 
 		 171 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  34.38 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  35.95 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 191 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 162 aa  64.7  0.0000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  33.09 
 
 		 171 aa  63.9  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  36 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  36.36 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  33.6 
 
 		 148 aa  63.9  0.000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  34.72 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.03 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.18 
 
 		 166 aa  61.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  35.88 
 
 		 214 aa  60.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 238 aa  60.8  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  30.46 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.92 
 
 		 183 aa  60.5  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  35.61 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  32.12 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  35.88 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33.1 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  31.55 
 
 		 171 aa  59.3  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.74 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  33.81 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.82 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  35.04 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  36.84 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  36.61 
 
 		 185 aa  58.2  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  36.23 
 
 		 153 aa  57.8  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  30.72 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  37.7 
 
 		 202 aa  57.8  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 169 aa  57.4  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  35.71 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  34.27 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  34.39 
 
 		 284 aa  55.1  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  34.27 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  29.83 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.63 
 
 		 166 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  33.55 
 
 		 227 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  34.11 
 
 		 161 aa  53.5  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  33.88 
 
 		 155 aa  53.5  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  28.36 
 
 		 184 aa  53.5  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  33.09 
 
 		 227 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32.89 
 
 		 227 aa  52.4  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  34.62 
 
 		 153 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0859  nuclease (SNase domain protein)  31.01 
 
 		 243 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  30.6 
 
 		 161 aa  51.6  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4628  SNase-like nuclease  33.83 
 
 		 242 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  33.58 
 
 		 258 aa  51.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5373  putative nuclease-like protein  34.59 
 
 		 176 aa  51.2  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0199446 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  30.41 
 
 		 266 aa  50.4  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2219  nuclease (SNase domain protein)  41.03 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4688  nuclease (SNase-like)  29.1 
 
 		 241 aa  49.7  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  31.11 
 
 		 358 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0782  nuclease (SNase-like)  33.08 
 
 		 242 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0873  nuclease (SNase domain protein)  32.41 
 
 		 146 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.485227 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  30.92 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  22.22 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5158  hypothetical protein  32.71 
 
 		 147 aa  48.5  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.275699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  27.32 
 
 		 180 aa  48.5  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0545  putative nuclease-like protein  29.31 
 
 		 241 aa  48.5  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0379373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  32.14 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  29.71 
 
 		 388 aa  48.1  0.00007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0447  nuclease (SNase-like)  31.5 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0276095  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  30.84 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  31.98 
 
 		 301 aa  47.4  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2315  nuclease (SNase domain protein)  31.55 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  34.4 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  24.68 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.39 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  29.55 
 
 		 221 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2030  nuclease  34.86 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    decreased coverage  0.000000000391548 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  21.79 
 
 		 183 aa  46.2  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  28.79 
 
 		 221 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  35.56 
 
 		 212 aa  46.2  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.47 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  22.53 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  28.47 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 165 aa  45.4  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>