142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0912 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  100 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  40.6 
 
 		 276 aa  95.1  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  35.6 
 
 		 346 aa  91.7  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  39.72 
 
 		 327 aa  90.5  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  42.21 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  38.32 
 
 		 258 aa  89.7  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  41.67 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  30.73 
 
 		 178 aa  87.8  9e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  37.93 
 
 		 231 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  37.09 
 
 		 350 aa  84.3  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  37.32 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  40.44 
 
 		 218 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  39.23 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  36.17 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  37.06 
 
 		 237 aa  80.5  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  37.42 
 
 		 271 aa  80.9  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  35.86 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  34.09 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  34.09 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  35.33 
 
 		 374 aa  74.7  0.0000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  35.04 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  36.57 
 
 		 214 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  32.61 
 
 		 351 aa  72  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  36.69 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  34.75 
 
 		 272 aa  70.5  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.04 
 
 		 267 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  33.56 
 
 		 278 aa  68.9  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  40.17 
 
 		 382 aa  68.9  0.00000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  35.34 
 
 		 273 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  33.57 
 
 		 255 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  37.21 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  39.82 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36.57 
 
 		 153 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  35.07 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  39.6 
 
 		 324 aa  65.5  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  33.09 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  35.07 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  34.59 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  31.47 
 
 		 255 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  40.16 
 
 		 259 aa  64.3  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  36.57 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  32.62 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  32.82 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  33.07 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  36.36 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  31.62 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  36.49 
 
 		 273 aa  62.8  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  37.5 
 
 		 284 aa  62  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  35.16 
 
 		 174 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  33.12 
 
 		 383 aa  61.6  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  37.16 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25.13 
 
 		 192 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  33.08 
 
 		 153 aa  61.2  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  33.83 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  29.45 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  29.25 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  29.55 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  29.55 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  35.77 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.45 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  33.83 
 
 		 372 aa  57.8  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  37.06 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  30.71 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.53 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  39.1 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  33.6 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.8 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.8 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  33.51 
 
 		 301 aa  55.5  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  31.78 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  39.33 
 
 		 388 aa  53.9  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  32.09 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.97 
 
 		 164 aa  53.9  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.53 
 
 		 238 aa  53.9  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  30.94 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  32.9 
 
 		 156 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  36.22 
 
 		 155 aa  53.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  32.43 
 
 		 333 aa  53.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  36.84 
 
 		 323 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  34.42 
 
 		 175 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  30.97 
 
 		 282 aa  52.8  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  37.59 
 
 		 153 aa  52  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  35.16 
 
 		 148 aa  51.6  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  29.79 
 
 		 249 aa  50.4  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  35 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  35 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  36.89 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  32.12 
 
 		 138 aa  50.1  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  32.26 
 
 		 534 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  37.88 
 
 		 153 aa  49.3  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  31.51 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  31.82 
 
 		 166 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.76 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  31.4 
 
 		 263 aa  48.5  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  36.11 
 
 		 179 aa  48.9  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  36.51 
 
 		 150 aa  48.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  28.08 
 
 		 183 aa  48.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  33.57 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  32.65 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>