168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2044 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  100 
 
 		 191 aa  362  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  36.06 
 
 		 271 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  39.13 
 
 		 276 aa  105  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  34.76 
 
 		 178 aa  105  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  43.54 
 
 		 327 aa  102  3e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  40.43 
 
 		 237 aa  102  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  46.97 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  38.58 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  38.58 
 
 		 190 aa  99.8  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  42.96 
 
 		 372 aa  97.8  8e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  39.57 
 
 		 351 aa  97.8  9e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  41.79 
 
 		 284 aa  94.4  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  46.31 
 
 		 175 aa  91.3  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  41.86 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  36.15 
 
 		 214 aa  86.3  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  34.04 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  37.06 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  34.04 
 
 		 214 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  25.95 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  31.94 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  31.94 
 
 		 228 aa  79  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  30.43 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  30.59 
 
 		 249 aa  77  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  35.37 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.81 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  28.49 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  37.8 
 
 		 255 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  31.58 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  43.17 
 
 		 323 aa  73.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  37.8 
 
 		 255 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  32.24 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  36.55 
 
 		 247 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  37.4 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  39.62 
 
 		 222 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  27.47 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  26.78 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  33.12 
 
 		 174 aa  72.8  0.000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  43.88 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  32.89 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  32.24 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  36.2 
 
 		 273 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  35.16 
 
 		 166 aa  72  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  29.1 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  37.68 
 
 		 278 aa  71.6  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  38.22 
 
 		 266 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  26.92 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  37.68 
 
 		 200 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  33.74 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  28 
 
 		 189 aa  69.7  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  37.93 
 
 		 346 aa  69.3  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  34.33 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  36.96 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  33.59 
 
 		 388 aa  68.6  0.00000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  36.69 
 
 		 260 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  32.12 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0382  nuclease  33.77 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3775  nuclease  34.07 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.770263  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1261  nuclease (SNase domain protein)  34.78 
 
 		 301 aa  67  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  36.43 
 
 		 260 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  36.42 
 
 		 273 aa  65.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  31.01 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  33.92 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  40.69 
 
 		 374 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  35.97 
 
 		 185 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3427  nuclease  36.94 
 
 		 263 aa  65.9  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.983203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  39.09 
 
 		 382 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  38.06 
 
 		 273 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  42.11 
 
 		 190 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  37.06 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  33.09 
 
 		 167 aa  63.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  29.75 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  35.61 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  37.12 
 
 		 273 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  34.75 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  32.91 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1665  nuclease (SNase domain protein)  34.55 
 
 		 203 aa  62  0.000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.409735  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.06 
 
 		 148 aa  62  0.000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  29.5 
 
 		 153 aa  61.6  0.000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  32.53 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  26.54 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  32.69 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  32.68 
 
 		 166 aa  60.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  36 
 
 		 153 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  30.32 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1176  nuclease  38.3 
 
 		 282 aa  59.3  0.00000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.78 
 
 		 169 aa  58.9  0.00000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  32.08 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  32.75 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  34.21 
 
 		 272 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  31.58 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  33.58 
 
 		 158 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  36.05 
 
 		 350 aa  57  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  29.45 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  33.07 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  41.48 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1691  nuclease  32.74 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0880921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  32.28 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  29.11 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  31.85 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>