115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0133 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0133  nuclease  100 
 
 		 231 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.247387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0076  hypothetical protein  43.82 
 
 		 251 aa  209  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0120  nuclease  40.32 
 
 		 288 aa  160  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.9034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  41.73 
 
 		 178 aa  87.4  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  39.53 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  39.53 
 
 		 190 aa  85.5  6e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0912  Micrococcal nuclease (thermonuclease)  41.18 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3634  nuclease (SNase domain protein)  41.74 
 
 		 382 aa  80.9  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.322659 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  39.61 
 
 		 200 aa  80.9  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  37.4 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  37.4 
 
 		 228 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  37.76 
 
 		 258 aa  79  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5232  nuclease (SNase domain protein)  36.69 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  34.03 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  33.93 
 
 		 372 aa  72  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  34.78 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  34.06 
 
 		 327 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1118  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 180 aa  70.5  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0389  nuclease  33.33 
 
 		 183 aa  69.7  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0448  nuclease  33.33 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0938967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1472  nuclease  33.56 
 
 		 183 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04500  nuclease (SNase domain protein)  37.3 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02740  micrococcal nuclease-like nuclease  31.54 
 
 		 259 aa  67.8  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0569  nuclease  28.8 
 
 		 192 aa  67  0.0000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  30.8 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0374  nuclease  29.88 
 
 		 346 aa  65.5  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.180384  hitchhiker  0.00530121 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  31.86 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  36.79 
 
 		 156 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  36.36 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2044  nuclease (SNase-like)  33.59 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  45.65 
 
 		 155 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0753  nuclease  28.82 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.838035  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0371  nuclease  30.92 
 
 		 350 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000121604  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  35.11 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4124  nuclease  39.45 
 
 		 260 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000792946  hitchhiker  0.000000518116 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0199  nuclease  36.7 
 
 		 374 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0844  nuclease  31.11 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  33.14 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  33.86 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0755  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 166 aa  60.1  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  28.05 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  32.31 
 
 		 153 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  29.61 
 
 		 267 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02380  micrococcal nuclease-like nuclease  27.13 
 
 		 408 aa  58.5  0.00000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0982  nuclease (SNase-like)  27.78 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000101814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  30.43 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  34.85 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  39.36 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  28.17 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  34.85 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2566  hypothetical protein  55 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  0.360636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2968  nuclease (SNase domain protein)  31.06 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00021469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  30.23 
 
 		 171 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  36.84 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0402  nuclease (SNase-like)  30.15 
 
 		 260 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3457  nuclease  30.67 
 
 		 222 aa  57  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000805339 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5135  staphylococcal nuclease-like protein  26.94 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  35.16 
 
 		 238 aa  55.5  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  32.26 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  30.99 
 
 		 166 aa  53.9  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0274  Excalibur domain protein  32.76 
 
 		 443 aa  54.3  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.611363  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5785  putative nuclease  26.97 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.397198  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4959  nuclease  29.92 
 
 		 273 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0889  nuclease  28.68 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000805707  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  36.36 
 
 		 115 aa  52.4  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0060  nuclease  28.67 
 
 		 351 aa  52.4  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5086  nuclease (SNase domain protein)  29.92 
 
 		 255 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0537  nuclease  28.24 
 
 		 286 aa  52.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  29.3 
 
 		 175 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2093  nuclease (SNase domain protein)  30.99 
 
 		 278 aa  52  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00243596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0379  nuclease  28.35 
 
 		 273 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.66 
 
 		 175 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  30.71 
 
 		 164 aa  51.2  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  28.86 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  26.97 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2838  nuclease  29.01 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.426487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  30.08 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  26.75 
 
 		 175 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  29.13 
 
 		 273 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  31.68 
 
 		 183 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2262  nuclease (SNase-like)  37.61 
 
 		 324 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.274888  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  33.33 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  28.77 
 
 		 266 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  29.33 
 
 		 216 aa  48.5  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  27.92 
 
 		 244 aa  48.5  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  32.62 
 
 		 180 aa  48.5  0.00009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2735  nuclease (SNase domain protein)  26.57 
 
 		 383 aa  48.1  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000147133  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  38.78 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  32.28 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  31.54 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  30.71 
 
 		 284 aa  46.6  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  25.48 
 
 		 171 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  28.36 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  28.05 
 
 		 534 aa  45.4  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  33.05 
 
 		 150 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  31.5 
 
 		 226 aa  45.4  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0504  Excalibur  42.11 
 
 		 138 aa  45.4  0.0007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1952  hypothetical protein  42.86 
 
 		 287 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1912  nuclease (SNase-like)  36.7 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  28.68 
 
 		 163 aa  45.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>